美國刺客兄弟會

耐心點，兄弟們。不久我們就會揭開《刺客教條：起始》《刺客教條：團結》《刺客教條：辛迪加》《刺客教條：末裔 - 可汗陵》《刺客教條：末裔 - 諸神的命運》《刺客教條：起源》與《刺客教條：血石》的秘密。 這篇文章被確認過時了。請更新這篇文章，以使它符合最新的涵義。完成之後，就移除這個模板吧。

美國刺客兄弟會（American Brotherhood of Assassins），其前身為殖民地刺客兄弟會（Colonial Brotherhood of Assassins），為刺客兄弟會在美國和加拿大地區的分支之一。 1746年，西印度群島兄弟會導師阿塔拜的最後一個學徒阿基裡斯·達文波特建立了殖民地兄弟會，作為北美大陸的英國殖民地的刺客公會，總部設在馬薩諸塞州的達文波特宅基地。

儘管與新法蘭西殖民地以及當地土著人民成立了聯盟，但在聖殿騎士殖民地分冊的操控下，殖民地兄弟會在法印戰爭中慘遭瓦解。在聖殿騎士殖民地分冊大師海瑟姆·肯威的領導下，加上謝伊·科馬克的叛變，聖殿騎士幾乎將殖民地兄弟連根拔起，只留下阿基裡斯一個殘廢。

時光荏苒，轉眼幾十年便已過去，殖民地兄弟會幾乎衰落到了不復存在的地步。而聖殿騎士們沒有了外患，一路勢如破竹，將整個美洲打造成為鐵板一塊。然而萬事皆有轉機，在美國革命前奏曲中，隨著年輕的莫霍克人拉通哈給頓——人們通常稱他為康納——的出現，這一切都將天翻地覆。康納不僅成為了阿基裡斯的新學徒，更是成為他心中新的烈焰、公會復興的基石。

在美國革命戰爭期間，康納積極支持革命家爭取獨立。就像當年謝伊所做的，他只要做好一件事情足以摧毀殖民地分冊，那就是刺殺了其所有主要成員，甚至包括他的父親海瑟姆。與此同時，他與大陸軍並肩作戰，幫助他們在逆境中求存。然而令康納沒有想到的是，這些愛國者們也沒有放過他的村莊，甚至將其焚為焦土。

革命成功後，該分會更名為美國兄弟會，繼續與美國協力擴張，參與了南北戰爭和第二次世界大戰等重大事件。二戰後，美國兄弟會愈發的壯大，並積極改革舊制，以迎來嶄新的國際時代。 在接下來半個世紀的鬥爭中，他們更多的採用社會運動來支持和操縱選舉的方式來壓制聖殿騎士，而非單純的暗殺。

不過，有聖殿騎士的地方，永遠不會停息的就是流血。最著名的例子便是1963年11月22日，與聖殿騎士有著政見分歧的美國總統約翰·肯尼迪被其刺殺。

儘管聖殿騎士依舊氣焰灼天，但仍有一些刺客堅持把自己隔絕於人世之外。像威廉·邁爾斯，他就將自己和自己的家人安置在位於南達科他州的「農場」。

2000年，刺客還尚未能確保阿爾·戈爾戰勝喬治·W·布什成為總統時，聖殿騎士團安插在美國刺客兄弟會的臥底丹尼爾·克洛斯在迪拜殺死了導師。隨後，他撤回聖殿騎士團，也因此泄露了他所造訪過的所有刺客營地和安全屋的位置，聖殿騎士據此展開了一場全球大清洗，其中又以美國兄弟會為最甚，清洗過後，十不存一。

野火燒不盡，春風吹又生。2012年12月21日，由肖恩·黑斯廷斯、瑞貝卡·克瑞恩、威廉·邁爾斯與其子戴斯蒙德·邁爾斯組成的小組在紐約都靈大神殿中揭開了伊述文明的秘密，並據此挫敗了聖殿騎士企圖控制世界的陰謀——Abstergo之眼計劃，將地球從即將到來的新一輪災難中拯救出來。

歷史

建立

「兄弟姐妹們，我寫這封信來告訴你們，一個新的兄弟會已在新世界建立。我已經聯合了許多英國殖民者，法國殖民者以及當地原住民，我還把諸多這樣的邀請函發往世界每個已知的角落，我相信我們之間的聯繫必將日益緊密。如果兄弟會想要取得成功，就得聯合所有國家，所有性別，所有種族中信奉刺客教條之人。希望你就是我所尋覓的人。」

―阿基裡斯·達文波特的邀請函，1746

眾所周知，加勒比刺客兄弟會的導師阿·塔拜曾與英屬殖民地的刺客有過接觸。 1740年前後，阿·塔拜的關門弟子阿基裡斯·達文波特被派往英屬北美大陸建立工會。也是在此處，阿基裡斯會見了法國刺客兄弟會的刺客議會成員約翰·德·拉圖爾。為了及時的察覺威脅。德·拉圖爾試圖建立一個籠罩整個殖民地地區的資訊網路。同時他也認為，這片土地上可能會擁有神殿和伊甸碎片。

在1758年的路易斯堡戰役中，德·拉圖爾預感到聖殿騎士很有可能會為了某種不可告人的目的而插手戰爭。於是他決定離開路易斯堡要塞，主動迎擊英軍。臨行前，德·拉圖爾將自己的刺客長袍交給了阿基裡斯，任命他為殖民地刺客兄弟會的導師，然後與眾人告別，不久後在戰鬥中壯烈犧牲。

次年，阿基裡斯繼承德·拉圖爾的遺志，正式成立了殖民地兄弟會。 並領導建立了兄弟會的總部達文波特家園 接下來的一年中，他分別結盟了英國殖民者、法國殖民者與當地土著。為了將兄弟會進一步發揚光大，他向全世界的刺客議會與刺客公會發出邀請函。在他的領導期間，殖民地兄弟會與其他諸多公會保持著定期通訊，包括英國、加勒比、法國、西班牙和聖多明克等諸多刺客兄弟會。此外，他們在斯德哥爾摩也有著盟友。

殖民地刺客兄弟會的總部，達文波特家園

在阿基裡斯1743年——那時殖民地兄弟會還沒成立——收下的門徒利亞姆·奧布萊恩的幫助下，阿基裡斯將幾位著名人物成功收入麾下。其中包括與法國陸軍有著密切聯繫的法國海軍指揮官，維綸德裡騎士，路易-約瑟夫·高緹耶。並透過這名指揮官與走私者和海盜成功搭線。還有獵人，他是一名優秀的高級間諜，此前也已經多次為兄弟會付出貢獻，也十分了解兄弟會的構成。

此外還有一個狼人僱傭兵肯瑟苟沃斯，並透過他得到了幾名戰士、獵人和偵察兵的支持，進一步加強了兄弟會的力量。還在1747年招募了霍普·詹森，並命其在紐約建立一個有組織的黑幫團伙，以便於向兄弟會提供資訊。

1748年，因其對航海技術的了解，利亞姆的前水手和兒時玩伴謝伊·科馬克被引進，並在當時成為殖民地兄弟會中第二優秀的水手。同年，阿基裡斯邀請瑪麗亞·范·安特衛彭加入兄弟會，但由於她致力於為荷蘭軍隊服務而遭拒。

除了自身的不懈努力，殖民地兄弟會也得到了法國刺客議會的幫助。1749年，法國議會建造了一艘名為天鷹號的三級風帆戰列艦，並將其作為刺客海軍艦隊的主艦。並在約1750年，由阿基裡斯擔任天鷹號艦長。在此期間，他曾救出一名資深水手羅伯特·福克納。這名水手為了報答他的救命之恩，在高緹耶的幫助下建立了一條航運路線，將殖民地兄弟會與歐洲刺客支部連接起來。

刺客海軍旗艦「天鷹號」

1751年，福克納開始調查兩個船運公司，萊夫斯基和德萊爾家族，懷疑他們是為聖殿騎士效命。1753年，福克納被任命為天鷹號的大副。這一時期，刺客將自己的勢力範圍拓展到了公海，其所領導的艦隊遨遊於廣闊的大西洋。

1751年，不列顛刺客兄弟會成員米科向阿基裡斯致信，信中他對殖民地兄弟會表示了由衷的讚賞，並同時闡述了聖殿騎士組織不列顛分冊對美國殖民地的威脅。阿基裡斯還收到了羅娜·丁斯莫爾的一封信，信中詳細描述了她被聖殿騎士拉斐爾·華金·德·費勒引誘的過程，並被其偷走了阿·塔拜留給她的描繪了尤卡坦半島上奇琴伊察神殿的古代地圖。羅娜拜託阿基裡斯一旦有機會，務必將其格殺。

尋找先行者

追尋神器

海地兄弟會的導師弗朗索瓦·麥坎達擁有著兩件第一文明產物，即先行者之盒和伏尼契手稿。手握這兩件神器，刺客便能鎖定包括太子港神殿幾數個第一文明神殿的位置。然而在麥坎達的一名學生星期五被派去調查太子港神殿時不幸觸發了防禦系統，導致了著名的1751年太子港大地震。星期五試圖逃離聖殿時被墜落的巨石碾碎了雙腿，尾隨而來的聖殿騎士大師勞倫斯·華盛頓割開了他的喉嚨，拿走了兩件神器。

試圖追回神器的刺客

亡羊補牢，為時未晚。1752年，阿基裡斯派刺客前去尋找這兩件神器。同年，謝伊和利亞姆被派去幫助高緹耶和他的部下。然而，這個小組不幸遭遇英國士兵的伏擊，一些走私者被抓走作為人質。於是他們兵分兩路，由高緹耶負責照顧他的部隊，利亞姆和謝伊則溜入敵軍營地，解救了人質。不僅解除了危機，還得到了一艘重型六級風帆戰艦，摩莉甘號。這大大增強了刺客的海軍能力。

1752年3月，阿基裡斯派謝伊尋找被聖殿騎士奪走的神器。 當謝伊，利亞姆和高緹耶一行三人與獵人會面時，他們得知這兩件神器可能在勞倫斯·華盛頓手中。 隨後他們在尾隨一個送給勞倫斯的包裹找到了勞倫斯位於弗農山莊的莊園。 謝伊偷走了包裹中的武器，隨後潛入了華盛頓的莊園，並得知勞倫斯將兩件神器分別託付給了塞繆爾·史密斯和詹姆斯·沃德羅普。在派對結束後，謝伊刺殺了華盛頓，隨即登上船隻，在迫擊炮的轟擊下狼狽脫逃。

1754年，刺客組織僱傭了一群僱傭兵，後者從威廉·約翰遜那裡偷走了一個箱子，裡面裝有他關於第一文明遺址位置研究成果。初來乍到的海瑟姆·肯維帶著一幫聖殿騎士，襲擊了研究成果所在的要塞，並將其奪回。離開前，海瑟姆警告苟活的傭兵們去通知他們的雇主，他們的時間結束了。

裡斯本災難

謝伊與霍普在調查手稿的地圖

在當年五月份，刺客組織探查到了剛從歐洲返回的塞繆爾·史密斯的蹤跡，並一路尾隨他所駕駛的「公正號」來到了特拉諾瓦島。 當船隻靠岸後，謝伊成功刺殺了塞繆爾·史密斯，並成功奪回了其手中的先行者之盒。兩個月後，謝伊又在奧爾巴尼市召開會議期間於該地發現了詹姆斯·沃德羅普的行蹤——他也隨即喪命於弗雷德裡克堡。 沃德羅普斃命後，刺客們尋回了伏尼契手稿，並向本傑明·富蘭克林求助如何啟動先行者之盒。為了達成該目的，謝伊與霍普幫助富蘭克林取回了後者遭到沒收的工具，並幫助其成功進行了實驗。在實驗中，他們為先行者之盒充能，並成功使這件神器投影出一幅標有數個第一文明遺蹟的全息地球圖，位於葡萄牙裡斯本的神殿即為其中之一。

次年，阿基裡斯·達文波特的妻子阿比蓋爾與兒子康納因罹患傷寒不幸去世，他堅定的信念因此而大受打擊。 之後，刺客們在雙灣集結，商討下一步的行動計劃；阿基裡斯決定派遣謝伊前往葡萄牙取回神殿內的伊甸碎片。

在當年的十一月份，謝伊抵達了裡斯本。上岸之後，他立刻前往了神器所在的卡爾莫修道院，並成功開啟了位於修道院地下藏有碎片的密室。然而，當謝伊剛一碰觸這件與世隔絕的聖物，他便立刻引發了一場大地震。無奈之下，他只得拋下破碎的神器慌忙逃生，但這場地震依舊奪去了成千上萬無辜者的性命。

謝伊的背叛

刺客們把謝伊逼入絕境

驚怒交加的謝伊懷疑是阿基裡斯一手策劃了裡斯本的毀滅，他隨即返回了達文波特家園，並和他的導師就此事當面對質，一口咬定阿基裡斯和大地震的發生脫不了干係。面對愛徒的質詢，阿基裡斯譴責了謝伊的魯莽無知，但二人都未能徹底平息自己的怒火，此事便以謝伊被從刺客訓練中除名而告終。然而，在經過幾番深思熟慮後，為了阻止更多城市淪陷於刺客所帶來的厄運中，謝伊潛入家園竊取了伏尼契手稿。正要逃離時，謝伊被守株待兔的阿基裡斯堵了個正著，再也無法心平氣和交談的師徒二人大打出手，爭鬥之中，謝伊破窗而出。

當謝伊試圖攜手稿逃亡時，被阿基裡斯召喚的其餘刺客紛紛前來阻止。混亂之中，維倫德裡騎士動用了達文波特家園的迫擊炮，用炮擊將謝伊逼至一處懸崖邊緣。儘管霍普對謝伊百般懇求，他仍舊無動於衷，最終被維倫德裡騎士開槍擊中，墜落於懸崖下的冰海裡。儘管已被刺客組織判定為死亡，謝伊仍舊幸運地被喬治·門羅上校所搭救，而後者則是一位聖殿騎士組織的高階成員。

同年，刺客們繼續委派本傑明·富蘭克林為組織製造全新的武器，以及將被用於戕害全體紐約市民的毒氣。他們的計劃被聖殿騎士們一一阻止，而此刻的謝伊卻仍被蒙在鼓裡，渾然不知自己正在和自己從前的敵手們並肩作戰。

肯瑟苟沃斯領導了針對門羅的埋伏行動

1757年8月，在威廉亨利堡圍城戰後，肯瑟苟沃斯率領一支刺客小隊伏擊了喬治·門羅和他的部下。謝伊成功瓦解了他們的埋伏，並從他昔日兄弟們的重重包圍中逃出生天。直到此時，刺客們才終於意識到謝伊大難不死，便立刻將其樹立為組織的刺殺目標之一。

之後，刺客組織聯手法國軍隊對一處支持英軍的奧奈達村落發動了襲擊，謝伊得以和英國軍隊一同挽救了這裡的人民。同年11月，肯瑟苟沃斯與利亞姆率軍突襲了奧爾巴尼，當門羅忙於部署防禦之時，謝伊將奪來的伏尼契手稿交託給了這位德高望重的聖殿前輩。守城戰中，面對來勢洶洶的法軍攻勢，謝伊用轉輪燧發槍擊殺了肯瑟苟沃斯，但利亞姆還是乘機重創了門羅。他奪走了手稿，並將這位瀕死的老人困在大火中，直至其在前來搭救的謝伊懷中咽下最後一息。

紐約的刺客會議

1759年10月，阿基裡斯、利亞姆、霍普與維倫德裡騎士在紐約碰面，共同準備前往下一處先行者遺蹟的遠征行動。其間，霍普向眾人承諾她能再現富蘭克林啟動先行者之盒的實驗成果，而一直暗中竊聽會議的謝伊則將這一消息傳遞給了聖殿騎士。為了擊破霍普一手掌控的犯罪網路，謝伊利用嫁禍之計，假扮黑幫成員策劃了一場針對軍隊哨所的劫案。聞風而動的英軍隨即掃蕩了霍普的宅邸，混戰之中，霍普與利亞姆透過盒子與手稿找到了他們的下一個目標——位於北極的先行者神殿。知悉結果的利亞姆獨自離開宅邸前去報信，而霍普則敏銳地向正在窗外窺伺的謝伊扣下了扳機。她取下了謝伊的防毒面罩，並向室內釋放毒氣，他雖僥倖從室內逃離，卻身中一枚霍普發射的毒鏢。謝伊抵抗著毒性的侵蝕窮追不捨，終於將霍普刺殺。霍普深知自己的反抗已為利亞姆的逃離拖延了足夠的時間，即使在生命的最後一刻，她也未對謝伊刺殺自己的行徑流露任何責難之意。

在北極的對抗

阿基裡斯與利亞姆攜手稿踏上了前往北極尋找神殿的旅途，維倫德裡騎士則將先行者之盒藏了起來，並故布疑陣，將謝伊引到了北大西洋。摩莉甘號和海東青號在北大西洋呼嘯的風雪中展開了一場海戰，謝伊的單桅帆船成功將刺客組織的戰艦挫敗。在登上海東青號和維倫德裡騎士對決時，謝伊才終於發覺自己中計，真正尋找神殿的人馬早已前往了遙遠的北方。面對維倫德裡騎士的嘲諷，謝伊以牙還牙，將他拋入了刺骨的海水中。

阿基裡斯被海瑟姆打殘

1760年3月，阿基裡斯和利亞姆終於率一支刺客小隊抵達了北極。這兩位殖民地最後的刺客領袖剛剛踏入極寒的洞窟中，摩莉甘號便緊隨而至。海瑟姆·肯維和謝伊潛入了刺客們的隊伍，搶先進入了神殿深處。另一邊，阿基裡斯與利亞姆也終於找到了神器，利亞姆急切地想要將神器取下，卻被阿基裡斯及時阻止，這位飽經風霜的刺客導師終於意識到謝伊的警告是正確的。就在此刻，謝伊與海瑟姆與兩名刺客狹路相逢。爭鬥間，利亞姆不慎令神器跌落，而大地也隨之開始震顫。眼看裡斯本的慘劇就要在北極的洞窟內重演，刺客與聖殿騎士們紛紛奪路而逃，而謝伊也和利亞姆開始了最後的纏鬥，利亞姆因此跌落懸崖。身受重傷的利亞姆指責謝伊背叛刺客的行徑，而謝伊則回答他希望拯救世界。一息尚存之際，這位謝伊昔日的好友諷刺道，希望他和聖殿騎士所拯救的世界不是邪惡的。

謝伊從老友的屍身上尋回了伏尼契手稿，與此同時，海爾森也將阿基裡斯打倒在地。謝伊提出要對這位自己曾經的導師手下留情幾分，因為刺客組織會在阿基裡斯死後繼續尋找神殿的行動。海瑟姆同意了謝伊的要求，但開槍擊中了阿基裡斯的右膝，使其殘疾的跛足永遠成為了刺客組織覆滅的紀念品。

衰落

北極神殿一事後不久，聖殿騎士們便對殖民地刺客展開了一場大清洗。1763年，苟延殘喘的刺客兄弟會最終在聖殿騎士組織的圍追堵截中被連根拔除，除了在清洗中被逮捕和折磨的阿基裡斯，其餘所有成員均被追殺殆盡。聖殿騎士們盲目地相信，這位刺客導師內心的鬥志已經在連年的劫難中被徹底摧毀。於是他們將阿基裡斯放歸故裡，使其在放棄一切刺客事業的前提下隱居在達文波特家園。 五年之後，羅伯特·福克納又將幾被聖殿騎士摧毀的天鷹號拖進了家園的港灣。

復興

阿基裡斯與拉通哈給頓首次見面

1769年，海瑟姆之子，於一處卡尼耶可哈卡村落長大的拉通哈給頓蒙受朱諾的指引，來到了達文波特家園。他在雨夜中奮力阻止暴徒侵占宅邸的義舉打動了阿基裡斯，使其准許這個莫霍克男孩開始刺客訓練。一年之後，拉通哈給頓正式加入了刺客兄弟會，與此同時，他也投身於福克納麾下，成為了天鷹號上一名合格的大副。在此期間，拉通哈給頓還陸續邀請戈弗雷、泰瑞與蘭斯·奧唐納等人前來達文波特家園居住。他們在使宅地變得日益繁榮昌盛的同時，也以自己的行動給予拉通哈給頓種種必要的支持。

康納與史蒂芬在波士頓傾茶事件中

1773年，已被阿基裡斯易名為「康納」的拉通哈給頓開始招募殖民地居民與新移民加入刺客組織。他的第一位同伴是廚師史蒂芬·夏菲爾——此人正在波士頓積極投身於反對威廉·約翰遜向殖民地人民強征高額印花稅的行動中。康納與史蒂芬二人均在日後參與了波士頓傾茶事件，成功斬斷了殖民地聖殿騎士的資金來源。

在康納出面解決了在波士頓北部作亂的幫派和殘暴的英軍徵兵員後，鄧肯·利托和克裡普·威爾金森也欣然加入了刺客的事業。 當兄弟會的人馬日漸壯大，康納便得以派出麾下的人手前往殖民地各處煽動叛亂，在新澤西州和馬裡蘭州也掀起了傾茶的浪潮。

1774年7月，在威廉·約翰遜尋找到新的資金來源，打算強買易洛魁族人的領地時，康納奪走了他的性命。然而，他隨即便從約翰遜的遺言中得知，聖殿騎士購買土地的真實意圖是為了保護原住民免遭歐洲殖民者的迫害。康納隨後又從約翰遜的身上找到了一封來自聖殿騎士約翰·皮特凱恩的密信，信中提到聖殿騎士打算摧毀愛國者們的武器和補給。

美國獨立戰爭

獨立戰爭的打響

1775年4月，刺客們認為皮特凱恩打算謀害塞繆爾·亞當斯與約翰·漢考克。康納與保羅·列維爾一同前往列剋星敦，警告當地的民兵組織，讓他們做好防禦英軍進攻的準備。在列剋星敦和康科德戰役中，康納指揮愛國者的民兵部隊與皮特凱恩率領的英軍正規軍交戰。蒙受沉重打擊的皮特凱恩逃離了戰場。隨著美國獨立革命的爆發，大陸軍包圍了波士頓，康納則在邦克山之役中殺死了皮特凱恩。臨死之前，皮特凱恩告訴康納，他並不是想要謀害亞當斯和漢考克，而是想要議和。之後，康納在他的屍體上發現了一封信，信中寫有刺殺喬治·華盛頓的指令。

美國獨立戰爭爆發之後，刺客們基本站在愛國者這一邊。一開始，他們協助攻占了聖讓堡。但之後，他們很快發覺魁北克的人民並不想要獨立，於是轉而盡力阻止誤入歧途的理查德·蒙哥馬利與威廉·湯普森兩位將軍繼續征服加拿大。刺客們還努力在波士頓被圍攻的時候維持城市的正常運作，為市民提供食物與保護。他們還協助亨利·諾克斯將火炮運往多切斯特高地，結束了英國對波士頓的占領。

1776年7月，康納前往紐約，準備消滅受命刺殺華盛頓的聖殿騎士托馬斯·希基。一番追逐之後，康納與希基兩人都被抓住，被送進了布萊德維監獄。在監獄裡，康納被聖殿騎士栽贓為企圖謀害喬治·華盛頓的兇手，將被處以絞刑。阿基裡斯與其他刺客趕到紐約，救下了已經被送上絞刑架的康納。其中一名刺客一箭射斷了康納的絞索，讓康納得以脫身前去刺殺希基。最後，趁著混亂打算謀害華盛頓的希基被康納殺死了。擔心華盛頓還會遭到謀害的康納想把刺客與聖殿騎士的存在告知華盛頓，但被阿基裡斯所勸阻。阿基裡斯認為，這麼做只會削弱華盛頓與大陸軍。之後，雖然刺客協助大陸軍獲得了哈林高地戰役的勝利，紐約還是落入英軍手中。

這一時期，康納造訪並協助雅克·曾格結束了戒嚴，和傑米·科利一起阻止了在先前大火中受災區域傳播天花的陰謀，還協助多比·卡特除掉了在城郊囤積糧食並哄抬價格的聖殿騎士商人；在此之後，這三人加入了刺客兄弟會，大大增強了兄弟會的實力。

破碎的同盟

康納與海瑟姆達成了暫時的合作關係

1777年，康納離開達文波特家園前往福吉谷，要向華盛頓說明刺客與聖殿騎士之間的戰爭。在福吉谷營地，華盛頓委託康納去尋找被聖殿騎士本傑明·丘奇偷走的補給品。調查途中，康納遇到了自己的父親。他的父親正因丘奇背叛聖殿騎士組織的行為而追查丘奇。這對父子因此決定休戰，前往馬提尼克殺死丘奇。

1778年7月，康納的父親揭露當年下令襲擊康納村子，害死康納母親的人正是華盛頓，華盛頓現在甚至還想對另一座村子發動襲擊。康納因此同華盛頓斷了往來。而他對父親隱瞞母親之死的真相如此之久而無法釋懷，與父親的停戰合作也到此為止。隨後，康納追上並殺死了大陸軍的信使，在戰鬥打響之前阻止了其他莫霍克人。但是為此康納不得不殺死他被聖殿騎士查爾斯·李煽動的朋友嘎納多貢。在蒙茅斯戰役中，康納協助被查爾斯·李蓄意破壞防禦後的大陸軍撤退。

對聖殿騎士的最後一戰

幾天之後，刺客們得知喬治·多倫斯迫使多個易洛魁人村莊遷徙，於是殺死了他。儘管如此，當戰事向北卡羅來納與佐治亞等南方殖民地推進時，刺客們還是為大陸軍提供了協助。他們在面對一個伯納斯特·塔爾頓的十分危險的騎兵將領時十分謹慎，盡一切可能保護那些在戰鬥中與他交手的美軍將領。

康納發現阿基裡斯已然過世

刺客們在北方也仍舊十分活躍。康納在1781年9月5日的切薩皮克灣海戰中協助了法國海軍，爭取到了法軍對攻打紐約喬治堡的支援。隨後，康納回到了達文波特家園，讓懷特醫生照料那些受傷的水手。回到宅邸，康納發現阿基裡斯已經過世。去世之前，阿基裡斯給康納寫了一封信。信中寫道，阿基裡斯的一切財產都由康納繼承，康納在他暮年生活中的出現給了他莫大的希望。他相信，這個在康納幫助下誕生的新生國家會有美好的未來。在葬禮結束之後，康納與家園的各位居民將阿基裡斯葬在了他妻子與兒子的墓旁，將他尊為「山上的老人（Old Man on the Hill）」。之後，康納將一副阿基裡斯摘下的畫掛了回去，這幅畫會讓阿基裡斯回想起痛苦的事情——畫中的人正是他已故的家人。

在紐約，史蒂芬、黛博拉、鄧肯與雅克前來協助拉法耶特侯爵清理前往喬治堡的地道，查爾斯·李正藏身於要塞之中。來到要塞裡追殺查爾斯·李的康納被法軍艦艇的炮擊波及，受了傷，隨後遇到了留在要塞裡的海瑟姆。海瑟姆告訴他，查爾斯·李已經逃走。隨後，這對父子開始了戰鬥。

海瑟姆襲擊康納

父子間一番決鬥之後，海瑟姆掐住了康納的喉嚨，想要勒死他。海瑟姆對康納毫無希望的目標進行了批判，但康納抓住機會，將袖劍刺進了海瑟姆的脖子。海瑟姆臨終時說道，他從某個方面來說很為康納自豪，但他之前本該把康納殺死的。

之後，康納拿到了海瑟姆的日記，讀到了父親悲慘的童年與遭到背叛的人生，還發現當初救了自己性命的也是父親：康納招募的刺客學徒射出的那一箭並未完全切斷絞索，是海瑟姆丟出的飛刀將絞索徹底切斷了。

康納的學徒被派往約克鎮，潛入並破壞了英軍的防禦工事，確保在有限的傷亡程度下儘可能快地讓英軍投降。

第二年，康納找到了李，卻因為身上的傷被抓住。因海瑟姆之死而怒不可遏的查爾斯·李聲稱他會讓康納活著，這樣，他就可以讓康納眼睜睜地看著自己摧毀一切康納所愛的人和事。隨後，查爾斯下令衛兵隨意處置康納後便離開了。衛兵開始毆打康納，但康納成功地逃走了。他偷偷登上了一艘運送囚犯的船，殺死了船上的主管軍官，得知查爾斯·李去了波士頓。

康納在波士頓的碼頭找到了查爾斯·李。看到康納出現的查爾斯拔腿就跑，兩人在還在修建的船裡展開了追逐。這艘船因為意外而起火。最後，康納在船的內部追上了查爾斯，但起火的船開始坍塌，康納因此受了重傷。

查爾斯緩了過來，質問康納為何在諸事都會徒勞無功，甚至被那些他所想要拯救的人背棄的情況下還要繼續戰鬥。康納只是嘶喊著回應道「因為沒有其他人還會這麼做了！」，然後一槍射中了查爾斯·李的腹部。之後，受傷的查爾斯·李逃出了熊熊燃燒的船。

康納刺殺查爾斯·李

康納一瘸一拐地走到航務長處，得知查爾斯·李逃往了蒙茅斯。來到蒙茅斯的康納在最後一杯酒館中找到了查爾斯·李，他身上還流著血，卻一言不發地喝著酒。看到康納之後，查爾斯·李將手中的酒遞給了他，康納接了過去。兩人一同坐在桌前，看著往來的酒館顧客。

最後，查爾斯·李的目光落到康納身上，默不作聲地點了點。心領神會的康納將袖劍刺進了查爾斯的心口，殺死了他。然後，康納將查爾斯·李的屍體靠在了桌板上，讓他看起來就像一個喝了太多酒的顧客一樣，取回了大神殿的鑰匙，很快就離開了。

獨立戰爭之後

重建組織

在美國獨立戰爭結束之後，康納將活動的重心轉移到了加強美國刺客兄弟會上，以此加強刺客在新生美國的實力。

伊斯奧沙來到達文波特家園

按照這個想法，康納試著將逃離原本主人聖殿騎士醫生艾德蒙·佐志的叛亂黑奴佩瑟絲·吉伯斯招募進刺客兄弟會。但是，康納不知如何應對佩瑟絲的固執態度，只能請求他在新奧爾良的刺客戰友艾弗琳·德·格朗普雷前來幫忙。他知道，艾弗琳更加熟悉解放奴隸這件事，並且小有名聲。勸說的過程十分艱難，但艾弗琳還是勸動了佩瑟絲，為刺殺佐志做好了準備，佩瑟絲也加入了刺客兄弟會。在那之後，兩人一同去了康納位於達文波特家園的宅邸。

1804年3月，康納給海地刺客伊斯奧沙寫了一封信，讓他為了接下來的革命接受更多的訓練。他很高興地接受了康納的邀請，來到了達文波特家園。

加利福尼亞淘金熱

1852年，加利福尼亞淘金潮時期，搭乘馬車途徑大盆地沙漠的工程師約翰·薩特被一位美國刺客襲擊。這位刺客跳到了薩特乘坐的馬車上，殺死了馬車車夫，用槍指著薩特，告訴他，在他奴役之下被送去挖礦的邁杜人想要把馬車上放著的他們挖出來的黃金還給他們。那一刻，這個刺客注意到遠處有一名槍手，搶在對方開槍之前向對方開了槍。

美國南北戰爭

1863年，一名名叫維琉斯的刺客在紐約市活動。他的導師指令他前去竊取藏在阿茲特克俱樂部的伊甸匕首，並將這把匕首轉交給尤利西斯·S·格蘭特將軍。維琉斯成功地拿到了伊甸匕首，但隨後就遭到了科吉爾·科馬克的襲擊，受傷之後匕首也被奪走。但是，維琉斯招募的新人伊莉莎大顯身手，奪回了匕首。匕首最後被順利地交到了格蘭特將軍手裡。

1865年4月14日，亞伯拉罕·林肯總統被聖殿騎士部下約翰·威爾克斯·布斯開槍刺殺。林肯遇刺後，刺客們追蹤並殺死了布斯。

現代

帕爾默大搜捕

1919年，刺客兄弟會的數名成員滲透了調查局，成為了這個組織中的特工，利用特工網路與政府的管轄職權推進刺客的事業。在帕爾默大搜捕中，刺客在調查局中的職權讓他們順利將安娜·奧列洛夫和娜迪婭·奧列洛夫兩人安全送回了俄羅斯。

爵士時代

爵士時代時，一位身份不明的美國刺客在美國境內活動。這位刺客與歐尼斯特·海明威、弗朗西斯·斯科特·菲茨傑拉德與格特魯德·斯坦等多名美國當時十分著名的人物有過交集。

與尼古拉·奧列洛夫的決鬥

1926年，美國刺客們幫助俄羅斯刺客謝爾蓋找到了藏身於康涅狄格州荒野之中的前刺客尼古拉·奧列洛夫。但是，謝爾蓋最後被尼古拉殺死了。

1928年，一支刺客小隊被派來追查尼古拉和他的兒子因諾肯季。找到之後，這些刺客試圖闖進尼古拉與因諾肯季所居住的小屋。但是，就在他們其中一人推開窗戶的時候，裝有爆炸物的小屋爆炸了。之後，剩餘的五名刺客衝進樹林中，追趕尼古拉與因諾肯季。其中一名刺客提議回頭聯繫調查局，另一個刺客則明確表示這是胡佛力所不能及的事情，他們只對兄弟會負責。這個刺客是這支小隊的隊長，他還說，自己不能告訴兄弟會一個老頭子殺死了他們半支小隊的人，他們在繼續追擊的時候決不能再冒風險。

發現尼古拉與因諾肯季的臨時營地後，隊長讓自己的隊員不要冒進，以免觸發另一枚炸彈。他告訴他們，他想活捉尼古拉與因諾肯季，要是他們發現了這兩個人，可以開槍把他們打殘。發現地上的血跡後不久，兩名刺客跟著血跡來到一顆倒下的樹旁，以為是他們的目標受傷後藏匿於此。但是這些血跡是尼古拉與因諾肯季用殺死的兔子設下的陷阱。那一瞬間，尼古拉從他們附近的樹上一躍而下，用袖劍刺穿了其中一名刺客的喉嚨，用匕首切開了另一個刺客的喉嚨。

但是，另一個刺客就在附近，開始用槍射擊尼古拉，成功地打中了尼古拉的右腿。子彈打光之後，這個刺客開始同尼古拉搏鬥。儘管尼古拉打破了他的鼻子，但這個刺客還是壓制住了尼古拉，用尼古拉的步槍瞄準了他。他聲稱，儘管他所收到的指令是活捉尼古拉，他個人卻更願意幫尼古拉「解脫」。但是，這個刺客被偷偷來到他身後的因諾肯季刺中了脖子。

隨後，最後一個刺客在尼古拉與因諾肯季準備用臨時滑索前往懸崖對面的時候追上了他們。因諾肯季藉助尼古拉的步槍抵達對面後，這個刺客一槍打中了準備順著滑索追上兒子的尼古拉。他靠近了受傷倒地的尼古拉，告訴尼古拉，他會把尼古拉帶回位於華盛頓的安全屋，從尼古拉嘴裡問出他在通古斯大爆炸中從皇家節杖中所得知的一切資訊。這個刺客告訴尼古拉，兄弟會要的是有關神器的情報，而並不在乎有關尼古拉的事情。

尼古拉與刺客同歸於盡

這個刺客說，他願意放走因諾肯季，警告尼古拉不要逼他改變想法，他知道因諾肯季跑不了多遠。但是，尼古拉回應稱，因諾肯季比十個他還要強，刺客永遠也找不到他。這個刺客隨後大聲對因諾肯季喊道，告訴他他的姐姐娜迪婭還活著，在俄羅斯有了自己的丈夫與孩子。但尼古拉卻說這個刺客只是在說謊，這個刺客反駁道兄弟會妥善安置好了安娜與娜迪婭——兄弟會會照顧自己人。因諾肯季從藏身處現身之後，尼古拉堅持說這個刺客是在說謊，讓因諾肯季不要相信他。然後，他告訴因諾肯季要「堅強」。萬分不情願的因諾肯季在尼古拉的勸說下舉起了步槍，將父親與刺客一同射殺。

第二次世界大戰

第二次世界大戰中，身為刺客的美軍上校鮑裡斯·帕什想要查明納粹德國核研究計劃「鈾工程」背後的秘密。這項計劃由身為聖殿騎士的德軍將領傑羅·克拉默主管。但是，帕什派去的刺客全部暴露了身份，被克拉默殺害。因此帕什只能變更他的計劃，派去一個不知道自己實際上是刺客的刺客。

1940年前的某個時候，帕什將受命潛入倫敦罪犯「傑克·特平」手下組織的間諜羅伯特·伯頓招募進了刺客兄弟會。這個「傑克·特平」實際上是一名德國黨衛軍軍官，名叫奧托·哈默斯坦，是個間諜。伯頓作為帕什的臥底，一直向帕什報告著哈默斯坦的動向。1940年9月7日，帕什得知哈默斯坦將僱傭碼頭工人艾迪·高姆竊取正在倫敦避難的法國科學家的研究成果。調查艾迪的背景後，帕什發現這位曾經的戰爭英雄實際上是不為人知的刺客後裔。隨後，他決定利用這個機會培養一個能夠靠近的克拉默的屬於兄弟會的間諜。他派另一個刺客——茱莉亞·達斯克中尉接觸了艾迪，試圖說服艾迪接受哈默斯坦的要求，為同盟國去做雙面間諜。但是，艾迪並不願意幫助他們。正當他們爭論時，德軍的轟炸機編隊轟炸了倫敦，其中一枚炸彈正中艾迪的家，炸死了他兄弟的遺孀瑪麗亞和她的兩個孩子賈斯汀和保羅。心灰意冷的艾迪借酒澆愁，直到一週之後帕什與達斯克兩人找到他。他們最終說服了艾迪。

在兩年的行動當中，艾迪加入了黨衛軍。這一時期，茱莉亞成為了艾迪在柏林的線人。1942年，艾迪已經以變節者的身份備受信任，成為了黨衛軍少尉軍官。艾迪用刀刺了哈默斯坦，成功地將海森堡劫為人質，威脅其他人說，要是不讓他帶著海森堡走出房間，他就用魯格手槍槍斃海森堡。隨後，艾迪質問海森堡，海森堡交代說他們在挪威維爾默克的水電站裡進行秘密計劃，製造一台名為「Die Glocke」的機器。

士兵們衝進房間裡，艾迪只能逃跑。幸運的是，茱莉亞破窗而入，救了艾迪一命，自己卻在與艾迪一起逃出建築時中了一槍。與帕什會合之後，三人乘上了逃跑用的車，逃走了。在前往城內藏身處的時候，艾迪認出了司機——羅伯特·伯頓，哈默斯坦的親信。他試圖勒死伯頓。但帕什阻止了艾迪，告訴他伯頓也是自己手下的特工。抵達藏身處後，伯頓處理了昏迷過去的茱莉亞的傷。帕什則將他們是刺客的事實告訴了艾迪。帕什還告訴艾迪，艾迪也是刺客的後裔。得知這些事情之後，艾迪決定成為刺客並加入了兄弟會。

在接下來的幾個月裡，艾迪參加了兄弟會的入會儀式，得到了帕什的訓練，成為了一名完全合格的刺客。1943年2月27日，艾迪空降到了維爾默克，消滅了黨衛軍守衛並潛入了水電站。但他抵達工廠中心的時候，克拉默正在那裡等著他的到來。艾迪知道克拉默是一個聖殿騎士。這時的克拉默坐在機器裡，手拿大刀。一番戰鬥之後，艾迪敗給了克拉默，被克拉默掐住脖子舉起了起來，最後暈了過去。

艾迪醒來之後，已經被克拉默捆在了機器的座椅上。這台機器由尼古拉·特斯拉發明。克拉默解釋說，這台安裝了特斯拉線圈的機器是一台重水反應堆，設計依靠的是艾迪1940年在倫敦幫忙劫持的法國科學家與伊甸蘋果，能夠探索與機器連接的人的過去。克拉默隨後坦白了他利用艾迪基因記憶的目的：艾迪繼承的是一支屬於刺客的很重要的血脈，他將利用這支血脈找到其他的伊甸碎片。特斯拉啟動機器之後，艾迪發出了痛苦的喊叫。

二戰之後

威廉·邁爾斯把Animus的藍圖交給梅傑婭·沃羅寧娜

1977年，刺客威廉·邁爾斯竊取Animus計劃藍圖後，在莫斯科遭到聖殿騎士特工的追擊。被刺客兄弟會的同袍梅傑婭·沃羅寧娜救下後，威廉將藍圖交給了她，請她搶在聖殿騎士之前製造出這台機器。梅傑婭問他該如何聯繫他，威廉告訴他說，她要在她救下他的地方與他見面，在滿月之夜的新舊動物園之間。威廉向梅傑婭保證，只要她在那裡，他就會知道的。隨後，威廉離開，前去與莫斯科另一支刺客小隊見面。

一張「農場」的照片

1987年，在南達科他州拉皮德市外的布拉克山，有一處名為「農場」的刺客據點。威廉·邁爾斯與他的妻子等三十來名刺客居住於此，但他們都已經不是刺客兄弟會的現役成員了。 那一年，威廉的兒子戴斯蒙德出生了。戴斯蒙德和其他在「農場」的孩子一樣，在威廉的管理下接受訓練。這份訓練強度很高，常常使得戴斯蒙德心驚膽戰。

20世紀90年代末，刺客與聖殿騎士為了爭奪總統的職位展開了一場政治上的鬥爭。刺客支持總統候選人為阿爾·戈爾，而聖殿騎士一方則支持他們的傀儡喬治·W·布什。

找到丹尼爾·克洛斯

1998年的一個晚上，刺客漢娜·米勒在費城的一家酒吧門外發現了醉醺醺的丹尼爾·克洛斯。丹尼爾嘴中念念有詞，漢娜正巧聽到他說出「聖殿騎士」這個名字。丹尼爾這時出血效應發作，聲稱一個路人是聖殿騎士，準備掏刀傷害那個路人。目睹這一幕的漢娜連忙出手阻止了丹尼爾，大聲地呵斥了他，讓他清醒了過來，然後又讓他做到了她汽車的後座上。在開車前往費城城外的刺客營地時，漢娜告訴丹尼爾，他也是一個刺客。

保羅·貝拉米在飯點和丹尼爾·克洛斯相遇

第二天早上，漢娜叫醒了睡在她房間裡的丹尼爾，告訴他，他們在所有刺客據點的成員名單中都找不到他的名字。丹尼爾也不知道她在說什麼。她帶著丹尼爾去見了營地主管保羅·貝拉米。保羅詢問了丹尼爾在何地接受訓練、作為刺客的職責為何等問題。但丹尼爾對眼下的情形只是感到困惑，沒有辦法回答這些問題。保羅問丹尼爾能否展示一下他的手臂，丹尼爾亮出了手臂，上面赫然有著刺客徽記的紋身，不過他本人並不知道這個徽記有什麼意思，只是覺得它「看起來很帥」「感覺很棒」。保羅將自己刻有刺客徽記的戒指展示給了丹尼爾，再次詢問丹尼爾的身份。這時，丹尼爾看見了來自過去的幻覺。

在丹尼爾重歷祖先尼古拉·奧列洛夫的基因記憶時，保羅發覺丹尼爾所使用的語言是俄語，聽到他提到「通古斯」這個地方。保羅問丹尼爾在幻覺中經歷了什麼，得知了丹尼爾與刺客組織之間的關聯所在，但丹尼爾本人對刺客的存在卻一無所知。

保羅控制住了丹尼爾

因為連續不斷的幻覺而深感不安的丹尼爾不願意與刺客們合作，憤然起身，想要離開營地。兩名刺客想要攔住他，卻被丹尼爾三下五除二地放倒在地。但是，保羅抓住了丹尼爾，用袖劍抵住了丹尼爾的喉嚨，終於攔住了他。

丹尼爾被關在營地房間裡的時候，保羅去聯繫了威廉·邁爾斯，向他詢問有關通古斯的情報。威廉收集了有關丹尼爾祖先與通古斯的情報，發現1908年曾有一隊刺客被派往通古斯回收一把伊甸權杖——皇家節杖。但這些刺客中只有一個人活了下來，這個人就是尼古拉·奧列洛夫，丹尼爾的曾祖父。

那天晚些時候，漢娜來到丹尼爾的房間裡，發現丹尼爾十分緊張。丹尼爾向漢娜吐露了自己的精神問題，請求她讓他到自己的公寓裡拿藥。漢娜很不情願地同意了丹尼爾的請求，把一件白色兜帽衫交給了丹尼爾。這樣一來，丹尼爾就可以混在其他刺客當中一同離開營地了。

漢娜抱怨丹尼爾的公寓環境實在邋遢時，丹尼爾在櫥櫃中翻找自己的藥。但他發現自己的藥都吃完了，漢娜只能試著安慰他，告訴他，如果他同意，刺客們會給他提供幫助的。

她向丹尼爾講述了她與刺客們度過的人生，他們的導師打算讓「他們的人」贏得這一年的總統選舉。丹尼爾表示，他在「幻覺」當中一直在追尋一個外形古怪的物品。然後，他在窗戶蒙著的水霧上給漢娜畫出了一個符號。漢娜當即認出了這個符號——伊甸權杖之一。

漢娜抱著丹尼爾

突然，保羅衝進公寓裡。呵斥漢娜違命行動之後，保羅把注意力放倒了丹尼爾身上。他溫柔地告訴丹尼爾留在公寓裡並不安全，他必須將丹尼爾曾祖父的經歷告訴他。但是，聽到尼古拉這個名字的丹尼爾又陷入了另一個幻覺。保羅催促丹尼爾告訴他們他頭腦中經歷了什麼，卻被丹尼爾一記右勾拳打在了臉上。

丹尼爾隨後逃出了公寓，一路來到屋頂上，但他眼中所看到的仍舊是1908年的那些事情。保羅和漢娜追在丹尼爾身後，懇求他下來回到他們身邊。幻覺來到整個行動的最高潮時，丹尼爾的眼前出現了各種各樣的圖案：伊甸蘋果、尼古拉·特斯拉、伊甸以及他自己出生時的場景。他隨後倒在地上，很快被漢娜抱起。丹尼爾告訴漢娜他沒事，表示自己終於找到了自己的目標——去見導師。

丹尼爾的冒險

丹尼爾在向刺客同伴講話，漢娜在他身後

接下來兩年裡，丹尼爾在漢娜的陪伴與支持下前往全球各地尋找有關導師下落的線索，拜訪了許多的刺客營地。每到一個地方，丹尼爾都會向他的刺客同伴們發起呼籲，請求他們的支持與指導。在某個時間點，丹尼爾還以私人身份與威廉見了面，威廉也相信了他的真誠。2000年11月5日，丹尼爾終於實現了他的願望。

在房間裡洗漱的時候，丹尼爾遭到了好幾個蒙面人的襲擊。在一番打鬥後，丹尼爾被那些蒙面人在脖子上注射了鎮定劑。等第二天醒來時，丹尼爾發現自己已經來到了導師位於迪拜的辦公室裡。

丹尼爾儘管一開始不確定自己身在何處，但很快就分析出了正在與他對話的人的身份。丹尼爾得知，導師一直在仔細關注他的旅程，他也知道丹尼爾所看到的幻覺，將丹尼爾視作刺客組織獨一無二的人才。

導師隨後向他解釋了「導師」這一頭銜與導師們所擁有的所有知識是如何代代流傳下來的。他還進一步解釋了刺客組織長久以來是如何變化執行方式，告訴丹尼爾刺客已經不再是簡單地除掉那些權勢過大或是過於貪婪的人了。

丹尼爾用袖劍刺殺導師

導師隨後將他自己的袖劍交給了丹尼爾，稱袖劍在現代已經基本屬於儀式道具，但還能正常地發揮作用。一接過袖劍，丹尼爾就感覺他是為使用袖劍而生的。但是，刺客兄弟會所不知道的是，丹尼爾還是個孩子的時候就被阿布斯泰戈做了實驗，沃倫·韋迪克在他腦中植入了一個隱藏衝動。在這個衝動的驅使下， 丹尼爾只要一有機會就會動手殺死導師。

因此，丹尼爾將袖劍戴到手臂上時，突然回憶起了這個這個衝動，在一瞬之間順從了衝動的指示，把袖劍刺進了導師的脖子。很快，他就對自己的行為感到了後悔，不確定他到底為何做出了這樣的事情。聽到門外傳來的聲音後，感到愧疚與困惑的丹尼爾撞破了落地窗，向著下方的海面一躍而下。然後，他開始前往此時唯一一個他覺得會歡迎他、保護他的地方——阿布斯泰戈。

大清洗

丹尼爾回到阿布斯泰戈的費城研究設施

11月21日，丹尼爾終於回到了位於費城的阿布斯泰戈研究設施。他一到那裡，就要求回到Animus裡；儘管丹尼爾先襲擊了一個運氣不好的秘書，沃倫·韋迪克還是相信了他的急切。丹尼爾被放到了Animus裡自由探索祖先尼古拉·奧列洛夫的記憶。這麼做對丹尼爾起到了鎮定作用。

不久後，丹尼爾被帶出了Animus，被綁在了醫療床上。在阿爾弗雷德·斯特恩斯等阿布斯泰戈高級職員的監督下，宋醫生被迫透過向丹尼爾注射SK-345取得有關刺客據點的情報。丹尼爾隨後吐露了他在過去兩年裡曾造訪的所有刺客藏身處的位置與秘密。因此，聖殿騎士得以發動「大清洗」，幾乎消滅了整個刺客兄弟會。

保羅下令讓成員撤離據點

在大清洗當中，許多刺客營地都被聖殿騎士發現被清剿。南達科他州、亞利桑那州、新墨西哥州與得克薩斯州的刺客據點均是如此。這些刺客營地、藏身處、據點裡幾乎所有刺客都遭到了阿布斯泰戈工業公司指揮下武裝特工的殺害，就連孩子也不例外。隨著聖殿騎士清剿即將到來的消息傳來，刺客營地開始組織緊急撤離。漢娜回到營地後，保羅將丹尼爾的叛變告訴了他。因為丹尼爾知道所有刺客營地的位置，保羅明確表示他們已經處於危險之中，必須放棄營地撤離。漢娜聽到這些話震驚地站在原地，不敢相信這是丹尼爾的所作所為。

儘管遭到襲擊的刺客很少能夠逃脫，但「農場」這樣基本脫離刺客兄弟會關係網的定居點因為得到了預先警告而得以安然無恙。導師死後，幾乎所有刺客據點都被聖殿騎士摧毀，倖存下來的刺客隱藏了起來，從秘密藏身處與分部展開隱秘行動。因此，刺客對於美國政治的影響灰飛煙滅，聖殿騎士順利地讓傀儡喬治·W·布什成為了美利堅合眾國的新任總統。

在接下來的十四個月裡，保羅·貝拉米等眾多刺客被阿布斯泰戈抓獲。阿布斯泰戈讓這些實驗體陷入了昏迷，在費城設施中強制讓他們留在Animi中探索祖先的基因記憶。

大清洗之後

導師死後，兄弟會的領導權最後轉移到了威廉·邁爾斯身上。威廉·邁爾斯開始主管兄弟會的諸多事務。

2003年，戴斯蒙德在16歲生日這一天貿然離開了「農場」，表示自己已經受夠了父母有關聖殿騎士的被害妄想，認為自己的父母只是陰謀論狂熱愛好者。刺客們儘管努力想要找到戴斯蒙德，卻一直沒有辦法將他帶回去。

雖然戴斯蒙德離開了「農場」，威廉還是忠實為兄弟會效命，透過他們的私設電子郵件網路與其他刺客分部保持聯繫。

2005年，他手下訓練的新人露西·斯提爾曼17歲了。威廉決定在兄弟會之外培養她。這麼做是為了保證她能夠神不知鬼不覺地滲透阿布斯泰戈工業公司，不過她與刺客兄弟會之間的關係也就這麼被切斷了。最後，露西接到了來自沃倫·韋迪克博士的聯繫，得到了一份在阿布斯泰戈工業公司的工作。她接受了這份工作，隨後與韋迪克一同參與阿尼穆斯項目的工作。

2007年前的某個時候，威廉接觸了同為埃齊奧·奧迪托雷·達·佛羅倫薩後裔的克萊·卡茨馬雷克，邀請他加入刺客兄弟會。克萊同意了威廉的邀請。

2010年，威廉將滲透阿布斯泰戈工業公司的任務委託給克萊。他所要做的是進入阿布斯泰戈首席執行官艾倫·裡金的個人電腦，揭露有關秘密「阿尼穆斯項目」的細節。克萊成功完成了任務，將一份記錄了阿尼穆斯項目投資總額、項目主管沃倫·韋迪克博士身份以及沃倫·韋迪克位於意大利新設施的位置等情報的郵件副本發給了刺客兄弟會。

在克萊任務成功的鼓勵下， 刺客們決定將克萊植入到阿布斯泰戈更深層次的地方——這一次是作為韋迪克博士實驗項目的實驗體。他得知，露西是刺客早前打入阿布斯泰戈內部的臥底。確認時機成熟時露西會幫助自己逃脫阿布斯泰戈後，克萊同意執行這項計劃。

2010年12月9日，助理教授肖恩·黑斯廷斯向wiki解密以「蓋伊·福克斯」的化名放出了有關阿布斯泰戈工業公司的機密資訊；阿布斯泰戈很快就攔截了資訊，肖恩也因此被綁架。第二天，肖恩在被押往別處時，刺客瑞貝卡·克瑞恩黑進了負責押送的阿布斯泰戈麵包車的車載電腦，讓車子顯示油量不足。等麵包車停車去加油的時候，瑞貝卡幫助肖恩逃了出來，並介紹他加入了刺客兄弟會。

2011年，聖殿騎士在丹尼爾·克洛斯的指揮下對一個刺客藏身處發動了襲擊。漢娜·米勒就在這個藏身處裡。為了給其他刺客爭取撤離時間，漢娜選擇斷後。她寄希望於能夠讓丹尼爾變回原來的自己，對丹尼爾曉之以理。但她失敗了，最後被丹尼爾親手殺死。

克萊的任務

滲透阿布斯泰戈

2011年2月1日，克萊被阿布斯泰戈家系研究與取得部的隊伍抓獲，以16號實驗體的身份被投入到阿尼穆斯項目中。他被沃倫·韋迪克關在阿尼穆斯項目實驗室裡，被迫重歷埃齊奧·奧迪托雷等祖先的記憶，每一次重歷的時間都長到極為危險的程度。

在此過程中，韋迪克一直隱瞞著自己基因探索的真正意圖，但克萊很快就明白這是在尋找一顆神秘的「伊甸蘋果」。克萊問到這件事的時候，韋迪克威脅似地回應稱，他要是知道他們到底在找什麼，他就不要再妄想能被放出去了。之後，威廉聯繫到了克萊，告訴他集中完成任務；等時機到來，露西會作為他的隊友將他救出去。

但是，刺客們並不知道露西這時已經叛變。獨自一人的多年生活，再加威廉沉默寡言又粗心大意的性格，露西離刺客越來越遠，轉而投入了聖殿騎士的懷抱。沃倫·韋迪克為露西提供教導與保護，而露西則心甘情願地成為韋迪克手下的雙面間諜。

最後，克萊發現了阿尼穆斯項目的真正意圖，決定是時候逃離實驗室了。不幸的是，這時他過度使用Animus的副作用發作，導致他飽受出血效應的折磨。不久，他發現，他已經可以在不使用Animus的情況下重歷祖先的記憶。其中一次重歷時，克萊發現祖先在與一個自稱朱諾的任務對話。朱諾告訴了克萊令他震驚的真相——本該是他夥伴的露西已經叛變，而他自己的命運也已註定只有悲慘的結局。

真相

「我保證會保護你，但我不能讓你離開。威廉和其他人永遠也不能知道。我很抱歉。」

―露西在寫給克萊的信裡寫道。

得知自己死期將近以及自己的意義只是為後來者戴斯蒙德·邁爾斯傳遞資訊的克萊勃然大怒。

為了說服克萊相信這一切都是必然的，朱諾向克萊展示了露西多年以來蒙受的由刺客組織帶來的孤獨與遺棄，只有這樣她才能更好地滲透聖殿騎士，卻也將她推向了刺客的對立面；她的任務是協助刺客找到伊甸蘋果，隨後將蘋果交給聖殿騎士。這份背叛使得克萊大為震驚，也讓他意識到了自己在未來諸多事件中應該扮演什麼樣的角色。

一段時間之後，露西發現克萊已經了解了她真正的意圖，想要解釋她的行為。她告訴克萊，威廉與刺客組織裡的其他人對他們追求目標時所摧毀的其他人的人生毫不關心，但聖殿騎士並非如此。

發現自己說服不了克萊之後，露西表示她會堅守承諾，保護克萊，向韋迪克隱瞞克萊這些新發現的蛛絲馬跡，但她絕不會讓他逃離實驗室。面對別無選擇的處境，克萊明白，只有一個辦法能將資訊傳遞給戴斯蒙德。

克萊之死與最後的訊息

克萊留給戴斯蒙德的訊息

在接下來幾週時間裡，克萊給他的自殺做了準備。他的準備細緻到了極致。他等待著時間，並且留下了他的資訊，同時還忍受著韋迪克為了找到伊甸蘋果下落一而再再而三的實驗。

最後，克萊在夜裡破解了Animus機器，成功地在Animus裡構築了一個自己的人工智慧程序，並將這個程序拆分成三十個碎片，等待後來者的收集與組合。他還給自己的父親寄了一份臨終電子郵件。

第二天，克萊用圓珠筆刺穿了自己的手腕，想讓自己體內的血液活活流干。他用這些血液在自己房間裡繪製了整整一面牆壁的加密資訊，希望後來者能夠發現這些他以死相傳的資訊。在他死後，阿布斯泰戈將他的屍體丟進了羅馬的台伯河。

戴斯蒙德之旅

被阿布斯泰戈抓獲

「我不是刺客……早就不是了。」

―戴斯蒙德對沃倫·韋迪克說道。

壞天氣夜總會裡，櫃檯後的戴斯蒙德

離開「農場」多年之後，戴斯蒙德最終來到了紐約，在一家名叫「壞天氣」的夜總會裡做酒吧招待。這份工作可能和他的長相有些關聯。他在「壞天氣」工作時，最喜歡喝的酒名叫「秀蘭·聖殿騎士」，是一種加了杜松子酒的秀蘭·鄧波爾雞尾酒。為了避開刺客的追查，戴斯蒙德從來不用自己的真名，買東西時也只用現金。隨著時間流逝，戴斯蒙德試著開始一段新的人生，但他有的時候還是會想念自己的家人和以前的朋友。

不幸的是，戴斯蒙德最後還是被阿布斯泰戈發現了。他在領取摩托車駕照時的指紋成了他暴露身份的線索。

戴斯蒙德被阿布斯泰戈人員抓捕

2012年9月1日，由丹尼爾·克洛斯指揮的阿布斯泰戈特工抓住了戴斯蒙德。第二天，戴斯蒙德在阿布斯泰戈羅馬研究所裡醒來時，已經成為了阿尼穆斯項目的新實驗體。

成為17號實驗體的戴斯蒙德被迫進入Animus，在沃倫·韋迪克與露西·斯提爾曼的監管下重歷祖先阿泰爾·伊本-拉阿哈德的記憶。阿泰爾是一名黎凡特刺客，活躍於第三次十字軍東征時期。但是，戴斯蒙德的潛意識抗拒著他們的努力，迫使沃倫和露西將戴斯蒙德從Animus裡帶出來。戴斯蒙德離開Animus之後，憤怒地表示自己只是一個普通的酒吧招待，但沃倫卻告訴他，阿布斯泰戈知道他以前作為刺客的人生，強迫戴斯蒙德承認他自己的過去。

Animus 1.28中的戴斯蒙德

戴斯蒙德隨後又遭到了沃倫的警告，他要是不和他們合作，那麼他們就會讓戴斯蒙德陷入昏迷再繼續他們的工作，等到工作完成之後就讓他自生自滅。沒有選擇的戴斯蒙德只能同意幫助他們。

在幾天的時間裡，戴斯蒙德在沃倫警惕的監視下重歷了阿泰爾的記憶。但在晚上，露西偷偷摸摸地把密碼交給了戴斯蒙德，戴斯蒙德因此可以離開分配給他的臥室，一探關押著他的實驗室的究竟。發現機會之後，戴斯蒙德打開了Animus的電腦。偷到沃倫的儲存筆後，他還打開了沃倫的私人電腦。

讀過私人郵件後，戴斯蒙德得知了更多有關阿布斯泰戈的事情，其中就包括了在他之前身在實驗室裡的16號實驗體。根據郵件內容，16號實驗體遭受著出血效應的折磨。最後，在露西的勸說下，刺客們決定出手救援戴斯蒙德，戴斯蒙德透過內部監控設備聽到了雙方交戰時的槍聲。

刺客們的救援失敗了，沃倫自豪地宣稱那些刺客實際上就是戴斯蒙德當年擺脫的刺客中剩下的人，他們隱藏在荒野之中的藏身處已經遭到了摧毀。等沃倫離開後，露西卻向戴斯蒙德保證說，被發現的營地已經被廢棄，戴斯蒙德的父母「很可能已經逃脫」。露西在對話中說服了戴斯蒙德，她告訴他，她也是一名刺客，被派來作為臥底刺探更多關於阿布斯泰戈計劃的內容。

戴斯蒙德完成對阿泰爾記憶的重歷時，為沃倫展現了一張記錄有許多伊甸碎片位置的世界地圖。三名阿布斯泰戈主管人員決定解決戴斯蒙德；他們認為，他們從戴斯蒙德身上獲得情報後，戴斯蒙德對他們來說已經與廢物無異。但是，露西制止了他們，認為戴斯蒙德的記憶還能進一步揭露其他伊甸碎片的下落，說服他們將戴斯蒙德留下來做更多的測試。

等主管人員都離開之後，戴斯蒙德發覺自己可以使用因為出血效應而從阿泰爾那裡繼承而來的鷹眼視覺。初次使用鷹眼視覺的戴斯蒙德看到了沃倫與露西真正關係的確切表述，以及實驗室與他房間牆壁與地板上數不清的塗寫下來的資訊與謎題。

逃到藏身處

戴斯蒙德與露西逃出阿布斯泰戈大樓

戴斯蒙德一個人在實驗室裡的時候，露西突然回到了實驗室，渾身是血，要求戴斯蒙德趕在阿布斯泰戈發現她所作所為之前立刻進入Animus。雖然困惑，但戴斯蒙德還是按照露西所說躺到了Animus機器上，成功同步了他與16號實驗體之間匹配上的最接近的基因記憶。這段記憶被儲存在Animus機器的嵌入式儲存器裡。在Animus裡，戴斯蒙德重歷了另一個祖先埃齊奧·奧迪托雷·達·佛羅倫薩的出生。然後，露西匆忙地中斷了他的重歷，讓戴斯蒙德跟自己一起逃離實驗室。

他們隨後被人數更多的阿布斯泰戈安保人員攔住了去路，但令戴斯蒙德吃驚的是，露西很快就解決了他們。他們繼續前進，穿過辦公部分與Animi機器之間的走廊，來到另一扇需要密碼的門前。出乎意料的是，露西的通行卡打不開這扇門，但戴斯蒙德用新獲得的鷹眼視覺發現了密碼，成功地打開了門。等他們來到停車場的時候，人數眾多的阿布斯泰戈安保人員攔住了他們，但兩人擊退了這些安保人員，來到露西的車旁。露西指令戴斯蒙德爬到車子的後備箱裡「保護好（他）自己」。對露西的要求很不滿的戴斯蒙德還是按照露西所說鑽進了後備箱。然後，露西開車帶著戴斯蒙德逃離了阿布斯泰戈的研究設施。

露西把戴斯蒙德介紹給瑞貝卡和肖恩

抵達刺客的藏身處後，露西把戴斯蒙德介紹給了另外兩名原來曾與露西合作的刺客——肖恩·黑斯廷斯與瑞貝卡·克瑞恩。露西告訴戴斯蒙德，他們想把他訓練成一個刺客。因為出血效應，這件事可能只需幾天就可以完成。但要這麼做，就要讓戴斯蒙德學習自己的祖先——那位與16號實驗體相匹配的祖先，埃齊奧·奧迪托雷。戴斯蒙德幾乎是當場同意，露西對此感到頗為驚訝。之後，他很快躺到了Animus 2.0的座椅上，開始重歷埃齊奧的記憶。

瑞貝卡向戴斯蒙德介紹Animus 2.0

但是戴斯蒙德、肖恩還有瑞貝卡不知道的是，戴斯蒙德能夠成功出逃，完全是沃倫與露西為了讓戴斯蒙德來到一個看似更安全的環境中，從他身上獲得更多情報而一手策劃的塞壬計劃的一部分。沃倫和露西都希望戴斯蒙德在刺客那邊能夠感覺更加自在，也就能更輕鬆地重歷重要的記憶；特別是阿布斯泰戈想要了解的那些記憶。只要刺客們一找到伊甸蘋果，露西就會聯繫沃倫。

戴斯蒙德在透過Animus從埃齊奧的經歷中學到刺客的本領之後，暫時離開了機器。這一方面是為了測試戴斯蒙德對他所了解的本領有多少掌握，也是為了避免16號實驗體之前過度使用Animus所遭受的精神問題。

戴斯蒙德正在經歷出血效應

露西讓戴斯蒙德去啟動藏身處周圍的安全設施，告訴他要利用鷹眼視覺與新學會的自由奔跑能力自己找到啟動那些設施的辦法。但就在開始之後，戴斯蒙德卻不斷地看到來自第三次十字軍東征時期的逼真幻象。一開始，這些幻象存在的時間很短，還不必擔心，但完成任務之後，戴斯蒙德卻因為幻覺愈發真實而失去了意識。

他在出血效應的影響下回到了中世紀的阿卡，在沒有使用Animus的情況下又一次重歷了阿泰爾的記憶。在幻覺中，戴斯蒙德發現阿泰爾與瑪利亞·索普有了一個孩子。這個孩子便是繼承了阿泰爾血脈，將其流傳給戴斯蒙德的祖先。

第二天，戴斯蒙德醒了過來，回到Animus裡繼續重歷埃齊奧的記憶。但他沒有把自己在幻覺中看到的事情告訴那些刺客隊友們。他對埃齊奧記憶的重歷十分順利，但卻因為「損壞的記憶序列」不得不暫停重歷。

最後他們得知，埃齊奧的敵人羅德裡戈·博吉亞在1492年成為了教皇亞歷山大六世，並且獲得了另一件伊甸碎片——教皇權杖，還發現梵蒂岡地下有一座密室。埃齊奧擊敗羅德裡戈進入密室後，看到一位「女神」的全息投影出現在他面前。那位「女神」自稱名叫「密涅瓦」。

密涅瓦向刺客們發出了有關世界末日的警告，並向他們講述了那場在「更早到來之人」與他們創造的人類之間爆發的戰爭的故事。當密涅瓦直接道出戴斯蒙德的名字時，所有人都震驚了，但直面密涅瓦投影的埃齊奧卻頗為困惑。密涅瓦表示，她實際上是透過埃齊奧對戴斯蒙德講話。不久，戴斯蒙德的重歷被中斷。他看到另外三人匆匆忙忙地收拾起了他們的東西，明白是聖殿騎士找到了他們。

沃倫·韋迪克在刺客們的藏身處與露西和戴斯蒙德對峙

等他從Animus躺椅上起來之後，露西把一把護臂上刻有刺客徽記的袖劍交給了戴斯蒙德，請他協助整支刺客小隊撤退。一路來到倉庫，出現在他們面前的是帶領著數名阿布斯泰戈安保人員的韋迪克。韋迪克帶人來便是想抓回戴斯蒙德。

戴斯蒙德與露西一起消滅了所有前來襲擊他們的聖殿騎士。其間，已經完全與埃齊奧同步並掌握埃齊奧全部本領的戴斯蒙德熟練地用袖劍殺死了許多安保人員。隨從人員全部倒下之後，沃倫·韋迪克只能獨自一人面對戴斯蒙德。面對這種情況，沃倫·韋迪克只能選擇撤退，臨走之前他保證刺客的勝利只會是曇花一現。

四名刺客隨後逃往北方，戴斯蒙德在麵包車裡繼續使用Animus在埃齊奧的記憶中尋找可能有用的線索。與此同時，其他刺客開始討論密涅瓦與她所說話語的背後真相。

藏進蒙特裡久尼

「我要是無法阻止幻覺出現怎麼辦？再過多久我就會在牆上塗畫符號了？」

―戴斯蒙德向露西詢問有關出血效應的事情。

戴斯蒙德的信仰之躍

因阿布斯泰戈襲擊了他們原本在倉庫中的基地，刺客們只能向北轉移，準備前往位於瑞士阿爾卑斯山的偏僻營地繼續探索戴斯蒙德的基因記憶。但是阿布斯泰戈在意大利格羅塞托設下了路障，攔住了他們的去路。靠著地圖決定去何處躲藏時，肖恩提議他們可以迂迴一下，繞路到蒙特裡久尼去。

之後，他們來到了蒙特裡久尼，這裡曾是意大利最後的刺客安全屋所在地之一。因為聖殿騎士正積極搜尋他們的下落，透過使用手機信號塔分析周圍環境後，這支刺客小隊不得不將設備全部搬到地下，搬進奧迪托雷別墅地下的聖堂裡。

肖恩和瑞貝卡進入奧迪托雷別墅

在尋找奧迪托雷別墅四週進入聖堂的辦法時，戴斯蒙德透過出血效應看到了埃齊奧在過去的身影。埃齊奧的幻象來到高處的一根很窄的橫梁上，隨後一躍而下。戴斯蒙德緊跟其後，因此施展了他人生中第一次信仰之躍，跳進了下方的稻草堆裡。然後，戴斯蒙德和露西從當年埃齊奧和蒙特裡久尼居民在1500年1月因博吉亞進攻而撤離時使用的地道抵達了聖堂。

兩人在地道中穿行的時候，戴斯蒙德看到了更多的幻象，深感困擾，讓他開始懷疑他最後也會「在牆上塗畫符號」。然後露西批評了他，告訴他不要用自己的狀態開玩笑，提醒他16號實驗體已經死掉，戴斯蒙德需要做的就是集中注意力。

戴斯蒙德在避難所使用Animus 2.01

兩人來到聖堂之後，戴斯蒙德再次看到了埃齊奧的幻象。這個埃齊奧似乎是在老年時期回來的。在打開通往馬裡奧·奧迪托雷辦公室的暗門前，戴斯蒙德注意到一邊的牆上寫著1419、1420與1421三個數字，然後他把這三個數字指給了別人看。肖恩分析說這三個數字可能指的是日期；但是他承認還需要對此做進一步研究。

等這支小隊完全安頓下來之後，戴斯蒙德受託前去電力接到聖堂裡面，把功率分配器安裝到蒙特裡久尼成立四個配電箱裡，從配電箱裡分出一小部分電力合在一起供給聖堂使用。解決供電問題後，戴斯蒙德繼續在Animus裡重歷埃齊奧的記憶。

在這段時間裡，肖恩在赫菲斯托斯電子郵件網路上從小隊其他成員和威廉邁爾斯那裡收到或給他們發送了不少電子郵件。威廉向肖恩提供了有關莫斯科、聖保羅、大阪與丹佛等地刺客分支位置與活動的情報，肖恩負責作為聖保羅分支聯繫時的接線人。威廉還告訴肖恩，如果他們找到了伊甸蘋果，他們要回到位於美國某處的刺客總部——刺客兄弟會現在的主基地，也是兄弟會高級成員的會面地點。威廉向肖恩保證說，刺客總部肯定有很多肖恩喜歡的東西，有「很多關於歷史的東西」。

在郵件裡，威廉告訴肖恩，丹佛分支出乎意料地失去了聯繫，可能意味著他們已經淪陷了，總部正在調查實際情況。之後，威廉告訴肖恩，總部人員抵達丹佛分支安全屋後發現裡面已經空無一物。這樣一來，要嘛是丹佛分支人員遭到了襲擊並被聖殿騎士抓獲，他們所有的設備也被拿走用作分析，要嘛就是丹佛分支在沒有發出警報的前提下進入了緊急狀態，在能夠通知總部之前就切斷了聯繫。威廉表示他希望是第二種狀況。

獲得蘋果

刺客們來到大競技場密室

雖然戴斯蒙德在埃齊奧·奧迪托雷·達·佛羅倫薩的記憶中找到了伊甸蘋果，但是現代的刺客們不知道該如何進入埃齊奧存放蘋果的密室。瑞貝卡知道密室的大門念出密碼就會打開，但是他們並不確定密碼應該是什麼。

戴斯蒙德提起了他之前在聖堂書架暗門後看到的寫在牆上的數字以及聖十結構符號。肖恩立刻推斷出這些數字與符號和上帝與祂的72個名字有關。肖恩還說，這個數字也正是羅馬大競技場開建的年份。

來到羅馬之後，戴斯蒙德等人選擇分頭行動。戴斯蒙德在大競技場遺蹟中攀爬穿行尋找道路的時候，其他人在地面上跟著戴斯蒙德移動。一路前往遺蹟深處時，戴斯蒙德數次看到朱諾的全息投影。最後他來到了天壇聖母堂，給其他幾人打開了大門。

朱諾的全息投影向戴斯蒙德講話

用DNA啟動一個古怪的基座後，教堂的天花板中降下來許多槓桿與結構。戴斯蒙德看到埃齊奧的幻象出現，很快又消失，給他指出了攀爬的路線。一路上，戴斯蒙德又看到了好幾次朱諾的全息投影。朱諾向戴斯蒙德解釋說，這座密室是作為唯一適合隱藏知識的地方而修建的。最後，戴斯蒙德來到一根槓桿連接的結構前，看到埃齊奧的幻象將槓桿拉了下去。按照幻象的動作拉下槓桿之後，另一個基座從地裡升了起來，天花板裡又降下幾根杆子幫助戴斯蒙德回到地面上。

再次DNA啟動基座後，戴斯蒙德啟動了一台升降梯，帶著所有人前往地下的密室。蘋果就在密室正中央的高台上。戴斯蒙德發現，要前往中間的高台就需要充分使用自由奔跑能力啟動機關。於是他在密室裡翻轉騰挪，拉下了數根槓桿。朱諾的投影在這期間又不斷地在各處出現。最後，通往高台的階梯升了起來。刺客們在向蘋果走去的時候看到，密室的四週出現了許多投影出來的符號。

戴斯蒙德在蘋果的影響下殺死了露西

但是，戴斯蒙德把蘋果從基座上拿起來的時候，聽到了朱諾的聲音，表示戴斯蒙德DNA已經啟動了蘋果。隨後，朱諾透過蘋果控制了戴斯蒙德的身體，強迫他用袖劍刺進露西的腹部。

然後，戴斯蒙德暈了過去。刺客們將他帶出了密室。戴斯蒙德因為被控制而陷入了休克，隨後在其他刺客的轉移下前往了未知的目的地。

這段時間，威廉·邁爾斯和佛羅倫薩分支美國成員哈蘭·康寧漢姆把戴斯蒙德放回了Animus機器裡。戴斯蒙德在昏迷狀態下重歷記憶時，看到埃齊奧與萊昂納多·達·芬奇發現了羅馬另一座沒有大競技場密室大的密室。埃齊奧的DNA啟動了密室內的機關，為戴斯蒙德記錄於此的坐標「43 39 19 N 75 27 42 W」出現在了密室的牆壁上。最後，重歷了更多記憶後，戴斯蒙德的身體狀況進一步惡化，陷入了深度昏厥之中。

阿泰爾II號

早期任務

阿泰爾II號

2012年，刺客領袖蓋文·班克斯想把阿泰爾II號這艘船搶來作為刺客兄弟會的移動總部，但他卻並不知道該怎麼開船。他遇到了加拿大刺客蘇珊·德雷頓，她想把這艘船偷走對付日本捕鯨船。蓋文和蘇珊同意合作，由蘇珊來擔任阿泰爾II號的船長

之後，蓋文和蘇珊在香港從阿布斯泰戈特工手裡救出了史蒂芬妮·趙博士。隨後，他們招募趙博士加入了兄弟會，並拜託她擔任阿泰爾II號的隨船醫生。

在某個時候，威廉·邁爾斯將身為刺客的退伍士兵埃曼努埃爾·巴拉薩調到阿泰爾II號上擔任軍械教練。埃曼努埃爾認為，威廉把他派到蓋文手下是把他當作負擔甩給了蓋文。

蓋文隨後救下了差點被阿布斯泰戈特工滅口的前阿布斯泰戈職員埃米特·利裡。半夜潛入埃米特家裡的蓋文一開始嚇了剛醒過來的埃米特一跳。但是，阿布斯泰戈特工趕來的時候，埃米特急著逃跑，於是他什麼問題都沒有問，穿著「緊身內褲」就跟著蓋文走了。之後，對外的消息聲稱埃米特已死，但他實際上成為了阿泰爾II號的船員之一，擔任整支小隊的駭客。

蓋文隨後招募了變性蘇格蘭人埃裡克·庫珀。復仇心切的埃裡克有條不紊地追蹤了害死他愛人的仇恨團伙，在愛丁堡殺死了他們。在受到招募的時候，埃裡克幾近自殺，卻因為他從來沒有感受過的蓋文與其他船員的溫暖歡迎與接納而煥如新生。成為阿泰爾II號的領航員與大副的埃裡克因為定期的荷爾蒙檢查和史蒂芬妮·趙成為了朋友，還因為埃米特·利裡太過放鬆而在指導中與他成為了朋友。因為埃裡克表示他有朝一日還想回蘇格蘭繼續過平靜的生活，埃米特經常替他關注他家鄉正在發生的事情。

後來，蓋文還救援了格魯吉亞假刺客兄弟會的剩餘倖存者。這個假兄弟會是阿卡基·尼尼茲與諾達爾·尼尼茲兄弟為了阻止格魯吉亞國內連續不斷的戰爭而成立的，雖然不是真正的刺客，他們也因為被聖殿騎士在多個方面進行打擊而一蹶不振。撤回潘基錫峽谷後，蓋文向這群自由鬥士們介紹了刺客-聖殿騎士戰爭這段秘密歷史。得知真相後，阿卡基與諾達爾都願意加入阿泰爾II號小隊，參加這場比他們祖國國內更大規模的戰爭。然後，貨真價實的新格魯吉亞刺客兄弟會建立了起來。

漫遊大海

阿泰爾II號內景

2012年9月10日，蓋文接到了一個刺客行動人員從澳大利亞布裡斯班用公共電話打來的電話。那個人告訴蓋文，他上次與隊伍聯繫已經過去了三天，之後一點消息都沒有。在蓋文讓那個刺客趕緊撤出布裡斯班之前，電話信號被切斷了。之後，蓋文私下確認布裡斯班小隊被聖殿騎士殲滅了。

兩天後，蓋文接到了一個名為珍妮絲的行動人員的電話。她是加拿大惠斯特刺客分支的領袖。她請求蓋文派遣援軍，她手下只剩兩名行動人員了。蓋文回復稱，他會確認自己能夠做什麼的。但電話那頭倖存的惠斯特小隊成員在那時遭到了丹尼爾·克洛斯所率領的聖殿騎士的襲擊。

幾周後，10月5日，蓋文給威廉·邁爾斯打了電話，向他告知了布裡斯班、大阪與莫斯科等地的刺客小隊的最新情況。身在意大利的威廉簡單地回復稱，他這邊的刺客正取得十分良好的進展。

美國之行

威廉小隊試圖逃離意大利時，哈蘭·康寧漢姆在10月16日收到了威廉發來的文字資訊，得知聖殿騎士正在追蹤他們，他們需要進行隱藏。

10月24日，蓋文從佛羅倫薩分支領袖阿德裡亞諾·馬埃斯特蘭齊那裡收到了加密資訊。阿德裡亞諾建議他前往紐約，並告訴他威廉很快就會和兄弟會其他人聯繫。在戴斯蒙德還在Animus裡的時候，威廉將瑞貝卡和戴斯蒙德轉移到了紐約，肖恩留在意大利打理露西的葬禮。10月25日，哈蘭再次接到了威廉的聯繫——威廉請求哈蘭協助他們逃離意大利。

10月27日早上9:51，哈蘭帶人伏擊了阿布斯泰戈戰術德爾塔小隊，殺死了數名聖殿騎士特工，是威廉小隊得以擺脫聖殿騎士的追蹤。哈蘭在10:38給威廉發了一條資訊，告訴威廉他們在交戰中只損失了一名刺客，而那個名叫丹尼爾·克洛斯的聖殿騎士在戰鬥中「失常」了。

之後，蓋文與威廉的小隊在紐約雪城的一座機場見面。蓋文給威廉等人提供了偽造檔案，幫他們安全地進入美國境內。

蓋文隨後開始週遊美國各地，替威廉小隊吸引聖殿騎士的注意力。11月2日，蓋文從俄克拉荷馬州斯蒂爾沃特發出資訊，告訴威廉他吸引注意力的行動完全成功。第二天，他又從新奧爾良發出資訊，向威廉告知了聖殿騎士襲擊佛羅倫薩刺客小隊的最新情況。

這個時候，威廉確認了伊甸蘋果的情況，發現自己並沒有能夠使用蘋果所需要的基因。抵達目的地後，威廉幫助瑞貝卡固定住戴斯蒙德，並監視著他的身體狀況。在照顧戴斯蒙德的同時，威廉向瑞貝卡與肖恩詢問了戴斯蒙德的狀況。他還提到了戴斯蒙德擁有高濃度伊述DNA的基因，正是如此戴斯蒙德才能使用伊甸蘋果。

昏迷的戴斯蒙德

探索黑室

「現在你應該躺在醫院的病床上，留著口水，咬著你自己的舌頭。現在是Animus維持著你的生命。是Animus保證你所有的祖先記憶沒有坍縮為一團混亂。但要是你找不到同步核心，你所有祖先的人格將會互相碰撞。那肯定不是什麼好事。」

―克萊向戴斯蒙德告知他眼下的精神狀況。

戴斯蒙德眺望Animus島

因為精神高度緊張，暴露在蘋果之下以及與露西之間發生的變故，戴斯蒙德陷入了昏厥之中。威廉指令瑞貝卡將戴斯蒙德放到Animus機器上，關閉Animus一切不必要的功能，以此穩定戴斯蒙德的狀況。因此，戴斯蒙德來到了黑屋——Animus核心程序設計中預置好的安全模式場景。

第一次在Animus島上醒來的時候，戴斯蒙德遇到了阿布斯泰戈阿尼穆斯項目16號實驗體克萊·卡茨馬雷克的虛擬身體。克萊向戴斯蒙德解釋說，戴斯蒙德需要繼續重歷祖先的記憶，直到這些記憶中對他毫無保留為止——他最後要抵達被克萊稱作「同步核心」的地方。只要戴斯蒙德找到同步核心，Animus就能夠將他的意識與阿泰爾以及埃齊奧相分離，他就能醒過來了。

戴斯蒙德在Animus島遇見克萊

克萊還冷漠地表示，要是戴斯蒙德抓緊時間還能趕得上露西的葬禮。聽到這句話，戴斯蒙德立刻回想起了大競技場密室裡發生的事情。對於自己的行為，他感到十分內疚，但他還是繼續進行對埃齊奧·奧迪托雷記憶的重歷，只有這樣他才能從昏迷中醒過來。

完成埃齊奧這部分記憶的第一個序列之後，戴斯蒙德個聽到了父親與瑞貝卡之間的對話。在對話中，戴斯蒙德得知威廉檢視了蘋果，瑞貝卡因此十分緊張。但是，威廉向她保證說他不覺得自己擁有用來使用蘋果的合適基因，瑞貝卡則猜測戴斯蒙德擁有那份合適的基因。

戴斯蒙德隨後被人拉出了記憶迴廊，回到了Animus島上。克萊解釋說，Animus檢測到戴斯蒙德離開了可以涉足的部分，所以他把戴斯蒙德帶回了島上，這是他保護戴斯蒙德思維完整的安全保障措施。他還告訴戴斯蒙德，他可以擾亂Animus，避免Animus把戴斯蒙德當成病毒刪除。

克萊向戴斯蒙德介紹同步核心傳送門

戴斯蒙德只要在君士坦丁堡各處收集到足夠多的資料碎片，就可以進入Animus的核心，回想自己的記憶——他出生長大的「農場」，所接受過的刺客訓練，他逃離「農場」的事情，在紐約市的生活以及他最後被阿布斯泰戈抓獲的經歷。

戴斯蒙德回憶起自己與父母間的關係，後悔自己沒有聽他們的話，也沒有及時履行他作為刺客應盡的義務。他表示他那些最輕鬆的日子已經過去許久，他也不再想要過那種日子了。

在特定的序列之間，戴斯蒙德會被克萊從埃齊奧的記憶中帶出來，回到Animus島上和克萊說說話。他們第一次聊天時談到了彼此。克萊問戴斯蒙德，他有沒有可能和戴斯蒙德在離開Animus時離開這裡。他想要尋找另一具他可以占據的身體。但是，戴斯蒙德猶豫之下拒絕了克萊想要離開的請求。克萊表示他明白戴斯蒙德拒絕的理由，為自己的處境發出了嘆息。

之後，克萊問戴斯蒙德，戴斯蒙德是否為他這一生中做過事感到後悔，比如離開父母，再比如長期拒絕接受自己作為刺客的身份之類的這些事。作為回應，戴斯蒙德承認自己本應該對父母更加耐心，承認自己與露西之間的事情本來可以與現在截然不同。之後，克萊感謝戴斯蒙德「講清楚了」。

克萊將戴斯蒙德從被刪除的結局中救了出去

第三次被帶出記憶的時候，戴斯蒙德發現Animus島的景象在他身邊破碎。克萊冷笑著表示Animus已經準備刪除他們了。隨著他們腳下虛擬的地面開始崩解，他抱住了戴斯蒙德。

戴斯蒙德因為事態突然而陷入了迷惑，也不知道克萊是不是想和他同歸於盡。但他猜錯了，克萊犧牲了自己，把戴斯蒙德推進了背後的傳送門，讓戴斯蒙德繼續重歷最後一段埃齊奧的記憶。

恢復知覺

「我知道我們需要做什麼了。」

―從昏迷中醒來的戴斯蒙德如是說道。

戴斯蒙德在同步核心見到了朱庇特

埃齊奧發現阿泰爾藏在圖書館裡的伊甸蘋果後，蘋果開始發光。埃齊奧回想起了自己在梵蒂岡密室裡的經歷，說出了戴斯蒙德的名字，他知道戴斯蒙德正聽著這一切。他催促戴斯蒙德去讓所有問題，他這一生所有經受的苦難都得到解答，都擁有意義。埃齊奧想讓戴斯蒙德為他的故事花上句點，將戴斯蒙德引向了同步核心。

在同步核心裡，戴斯蒙德遇到了另一名第一文明的成員——朱庇特。朱庇特解釋道，第一文明的其他成員在世界各地都修建了密室，每一個都在研究不同的拯救地球免於太陽風暴災難的辦法。所有密室的發現都被傳輸到大神殿（位於今紐約州北部），由朱庇特、朱諾以及密涅瓦整理。最後，他們測試了六個解決方案，儘管這些方案全部失敗，卻也看到了取得重大突破的希望。不幸的是，在他們得到結論前，巨大的太陽風暴襲擊了地球，幾乎消滅了整個第一文明。只有不到一萬個人類和比人類還少的第一文明成員倖存了下來，不過兩個種族摒棄前嫌，在巨災之後為了重建文明而鼎力合作。

戴斯蒙德從昏迷中醒來

朱庇特隨後交給戴斯蒙德一個任務：去大神殿。他告訴戴斯蒙德要帶去他的話語，將「它們從（他的）頭腦轉移到（他的）手上」，只有這樣他才能「開闢通道」。但是，他警告戴斯蒙德說，他也不知道事情對他自己或對戴斯蒙德而言會如何結束。在此之後，戴斯蒙德從昏迷中醒了過來，肖恩、瑞貝卡與他的父親都站在他的身邊。他從Animus躺椅上坐了起來，環顧四週，告訴其他人他已經知道他們接下來要做什麼事情了。

阻止第二次災難

進入大神殿

大神殿內的戴斯蒙德、威廉、肖恩和瑞貝卡

戴斯蒙德、威廉、肖恩與瑞貝卡很快就來到了大神殿，戴斯蒙德用伊甸蘋果打開了大神殿的大門。但是，大神殿因此激發了戴斯蒙德的出血效應，告訴戴斯蒙德若要打開大神殿內殿的門需要一把鑰匙。因為出血效應再次讓戴斯蒙德的思維陷入了短暫的神遊狀態，其他人只能再把他放回Animus裡。

重歷18世紀聖殿騎士海瑟姆·肯維的記憶後，戴斯蒙德得知海瑟姆手裡的大神殿鑰匙最後會到海瑟姆私生子拉通哈給頓手中。隨後，戴斯蒙德開始在記憶中尋找這把鑰匙。他有時會離開Animus，探索大神殿內部的情況，會像大競技場密室那時一樣遇到朱諾的投影。朱諾向戴斯蒙德詳細介紹了第一文明曾為拯救世界不受巨災侵害而嘗試過的六種方案，同時還催促他趕緊找到大神殿的鑰匙。

戴斯蒙德面對丹尼爾·克洛斯

但是，戴斯蒙德在Animus的重歷因為大神殿能源不足而不得不中斷了。因為肖恩的追蹤，他們發現第一個能量源位於紐約曼哈頓。戴斯蒙德來到了曼哈頓，執行了他作為刺客的第一項正式任務，爬上了一座摩天大樓，從起重機頂上一躍而下，打開降落傘落到存放著能量源的建築頂上。來到存放能量源的辦公室後，他遇到了聖殿騎士行動人員丹尼爾·克洛斯。為了逃脫，戴斯蒙德繳了丹尼爾的械，把他打暈了過去。

在進一步探索大神殿之後，戴斯蒙德意識到在內殿門後等待刺客的事情可能在某個方面來說對朱諾有好處。但戴斯蒙德也不知道那件事情要怎麼對朱諾有利，只是警告其他人要「謹慎行事」。他還告訴其他人，朱諾曾在大競技場密室中出現在他面前，向他展示露西如果還活著就會把伊甸蘋果帶走交給阿布斯泰戈供Abstergo之眼衛星使用，但衛星計劃最後還是會失敗。因此，戴斯蒙德只能說實際上他不是被迫殺死露西的，他是為了阻止聖殿騎士取得優勢。

11月27日，威廉從阿德裡亞諾那裡收到了資訊。阿德裡亞諾在資訊中證實了威廉有關聖殿騎士意圖破解他們系統的懷疑。阿德裡亞諾還表示，他決定進行一次「惡意收購」，將組織自己的分部對位於羅馬的阿布斯泰戈總部發動襲擊。

2012年11月28日下午5:08，威廉收到了位於意大利SP11省道的哈蘭發來的資訊，得知他們已經潛入了阿布斯田哥的園區，殺死了四個駭客與數名守衛，摧毀了那裡的伺服器，這意味著阿布斯泰戈無法繼續追蹤威廉。11月29日返回佛羅倫薩安全屋後，哈蘭發現他與分部裡的另一名成員遭到追蹤，安全屋被發現。他在晚上10:42給威廉發了資訊，告訴他襲擊即將到來，阿德裡亞諾卻拒絕離開。

阿布斯泰戈的襲擊在第二天早上6:27打響。哈蘭順利逃出了安全屋，其他刺客全部遇害，阿德裡亞諾引爆了炸彈，銷毀了所有的刺客檔案。哈蘭確認，除了躲過爆炸的尤哈尼·奧措·貝格，所有參與襲擊的聖殿騎士特工全部陣亡。哈蘭逃往了意大利的博洛尼亞，並在12月1日的中午12:20給威廉發了資訊，向他告知了發生的事情，以及自己即將「保持靜默」的事情。威廉的回應是告訴他要堅強。

戴斯蒙德在巴西追逐克洛斯

一段時間後，肖恩發現第二個能量源屬於一個有錢的女子，她真要去巴西聖保羅欣賞武術錦標賽。來到體育館後，戴斯蒙德依靠房梁一路潛入，來到了女子所在的房間，卻再次遇到了丹尼爾·克洛斯。丹尼爾開槍射殺女子與她的丈夫之後，試圖帶著能量源逃跑。但是，戴斯蒙德追上了他，最後在徒手格鬥中再次打暈了丹尼爾，順利逃脫。

阿泰爾II號離開巴西

取得能量源後，戴斯蒙德擺脫了追趕他的阿布斯泰戈特工，搭乘地鐵逃離了體育館。他和他的小隊隨後搭乘阿泰爾II號離開了巴西，回到了大神殿。回到大神殿之後，威廉給蓋文發了一條資訊，告訴蓋文整支小隊都安全地回到了位於圖靈的大神殿。威廉還補充說，聖殿騎士沒有在追蹤他們，感謝蓋文帶他們回紐約。

肖恩確定第三個能量源位於埃及開羅的博物館。但是，對這支小隊而言，12月21日的最後期限即將到來，戴斯蒙德還沒有找到打開內殿大門的鑰匙。威廉於是決定代替戴斯蒙德前去取回能量源。抵達開羅之後，他給戴斯蒙德發了郵件，要戴斯蒙德放鬆，因為他自己「在（戴斯蒙德）出生以前就在和那些混蛋戰鬥了。」

營救威廉

韋迪克認為這是個機會，於是派遣已經成為聖殿騎士大師的尤哈尼·奧措·貝格前去開羅博物館抓住威廉。抓住威廉後，阿布斯泰戈將他帶到了戴斯蒙德幾個月前被囚禁的地方。威廉被放進了Animus，卻拒絕服從聖殿騎士的指令。他知道，這樣做就可以阻止阿布斯泰戈利用他的記憶取得任何進展了。

在戴斯蒙德重歷更多拉通哈給頓的記憶後，刺客們收到了沃倫·韋迪克發來的影片資訊。沃倫·韋迪克在資訊中表示阿布斯泰戈的特工在博物館裡抓到了威廉，把他帶到了阿布斯泰戈羅馬研究所。他表示，戴斯蒙德若要救出自己的父親，就需要交出伊甸蘋果。作為答覆，戴斯蒙德同意去羅馬，但是他選擇的是獨自一人對阿布斯泰戈的總部發起襲擊。不久之後，戴斯蒙德和肖恩、瑞貝卡一起來到了阿布斯泰戈總部。

走進建築後，韋迪克透過內部廣播向戴斯蒙德提議進行和平交易，但遭到了戴斯蒙德的拒絕。戴斯蒙德一邊前往上層，一邊放倒沿路的安保人員，最後來到了自己幾個月前被關押的Animus房間外。就在那裡，丹尼爾·克洛斯再次出現在戴斯蒙德面前，指令他交出蘋果。在丹尼爾對戴斯蒙德開槍之前，蘋果讓丹尼爾的出血效應發作，丹尼爾突然之間說出了俄語。恐慌之下，丹尼爾落荒而逃，戴斯蒙德則緊追其後。最後，兩人在聖殿騎士用來進行虛擬戰鬥訓練計劃的房間裡做出了了斷，戴斯蒙德追上了丹尼爾·克洛斯，用袖劍刺殺了他，奪得了丹尼爾的手槍。

戴斯蒙德對阿布斯泰戈保安使用蘋果

戴斯蒙德一路向前，搭乘電梯來到韋迪克辦公室所在的五樓，沿路的安保人員全部被他殺死。在去辦公室的路上，韋迪克在內部廣播中解釋了自己的憤怒，他聲稱丹尼爾就像是他的兒子，戴斯蒙德和刺客只會奪走伊甸蘋果和露西·斯提爾曼的生命這些不屬於他們的東西。最後，戴斯蒙德來到了韋迪克的辦公室，威廉就被關在裡面。在韋迪克讓戴斯蒙德把蘋果交給他之後，戴斯蒙德利用蘋果控制了房間裡所有的安保人員，讓其中一人槍斃了韋迪克，隨後讓他們紛紛開槍自殺。

給父親鬆綁之後，戴斯蒙德擁抱了父親，帶上能量源與父親一起逃離了阿布斯泰戈總部，一路使用伊甸蘋果提供掩護。回到大神殿之後，他把能量源放進對應的槽位，得知了第一文明最後嘗試的兩種方案的細節，隨後再次進入Animus中重歷記憶。

12月19日晚上9:12，哈蘭身在奧地利維也納，用手機聯繫了蓋文。哈蘭確認自己已經擺脫了聖殿騎士，抵達了安全屋。他們開始討論阿德裡亞諾與他們對他的思念，哈蘭表示自己對留下他斷後這件事很內疚。蓋文向他保證說，阿德裡亞諾的死並不是他的錯，告訴他接下來前往荷蘭鹿特丹等待他的接下來的指示。哈蘭隨後告訴蓋文自己已經做好了準備，蓋文告訴他接下來可以試著放鬆自己。

戴斯蒙德的犧牲

結束對拉通哈給頓記憶的重歷後，戴斯蒙德得知拉通哈給頓最後把大神殿內殿屏障的鑰匙埋在了馬薩諸塞州達文波特家園外的墓地裡。刺客小隊去了那個地方，從康納·達文波特的墓中找到了鑰匙並回到了大神殿。

威廉把這些消息告訴了蓋文，蓋文則把這些消息轉達給了刺客兄弟會的其餘成員。用鑰匙打開內殿大門後，戴斯蒙德、威廉、肖恩和瑞貝卡進入了內殿。

朱諾向戴斯蒙德解釋她的解決方案

來到內殿的中央房間之後，刺客們在安裝有大型球體的基座前遇到了朱諾的投影。朱諾說，戴斯蒙德需要觸碰那個球體，這樣世界就能得救。但是，就在這時，密涅瓦出現了，警告戴斯蒙德不要去碰球體。她解釋道，朱諾原本想利用第一文明技術征服世界，而不是想拯救世界。因此，當年密涅瓦將朱諾囚禁在大神殿裡，阻止了朱諾的陰謀。儘管刺客們面前的基座可以保護地球不受太陽風暴襲擊，但是戴斯蒙德會為此犧牲，朱諾也會得到釋放，繼續實現她統治世界的野心。

朱諾因密涅瓦的出現而倍感震驚，於是讓密涅瓦向戴斯蒙德展示沒能阻止這次災難的後果。密涅瓦說，因為這次災難，地球上絕大部分人類都會死去，只有很少的人能倖存下去。戴斯蒙德將會成為災後新世界愛與希望的象徵，就和耶穌基督如出一轍，在他死後，他所留下的話語將被追隨者曲解與腐化，導致戰爭的爆發，讓人類歷史重蹈宗教戰爭的覆轍。

儘管如此，密涅瓦請求戴斯蒙德即使讓地球熊熊燃燒也不要為了拯救她而釋放朱諾。戴斯蒙德表示，就算朱諾得到釋放，人類也還有機會去阻止她。哪怕十分渺茫，這個機會仍舊存在。但如果世界為了阻止朱諾而被太陽風暴直接摧毀，將有不計其數的人死去，希望將不復存在。明白戴斯蒙德的抉擇後，密涅瓦告訴戴斯蒙德，這件事的結果將由「他的生死來承擔」。

戴斯蒙德犧牲了自己，拯救了世界

下定決心做出選擇之後，戴斯蒙德轉身面向威廉、肖恩和瑞貝卡，指令他們趕快離開大神殿，走得越遠越好。威廉求他再考慮一下，去尋找另外的辦法，但戴斯蒙德拒絕了。他表示，要另找辦法已經來不及了。被戴斯蒙德勸動的威廉、肖恩與瑞貝卡只能匆匆地離開了大神殿。

三人離開後，戴斯蒙德走向基座。戴斯蒙德在朱諾的注視下把手放到球體之上，身體因為劇痛而劇烈顫抖起來，渾身發出耀眼的金光；片刻之後，他倒在了地上，為了讓地球免遭第二次巨災的襲擊而犧牲了自己的生命。之後，朱諾跨過了戴斯蒙德的屍體，說出了對戴斯蒙德表示感謝的台詞。

第二次災難之後

權力交接

阿泰爾II號上的蓋文

接下來的六個月裡，威廉、肖恩與瑞貝卡東躲西藏。最後，威廉因難以承受失去兒子的痛苦而決定脫離兄弟會。他把自己所有知道的東西都在了一本書裡，把這本書交給了蓋文，幫他領導、重建刺客兄弟會。威廉還給蓋文寫了一封信，在信中告訴蓋文，他決定隱居，為將領導兄弟會重任交給蓋文而向蓋文道歉。同時他也在信裡明確表達他離開兄弟會的決定已經敲定。

肖恩和瑞貝卡花了一段時間去尋找威廉，但一無所獲。2013年5月14日，蓋文收到了一條肖恩發來的密文資訊，內容為前去秘魯將肖恩和瑞貝卡兩人接到船上。隨後，蓋文等人駕船前往秘魯，在5月21日和肖恩、瑞貝卡見面。肖恩在見面後把威廉的手札與信交給了蓋文。蓋文讀完信後，肖恩問他接下來威廉怎麼辦。蓋文感覺眼下什麼都做不了，只能等待，同時繼續完成他們分內的工作。

接下來幾天時間裡，在阿泰爾II號一路北上的時候，蓋文和船員們對這艘船進行了改進。5月29日，他們抵達了加利福尼亞州。蓋文問肖恩與瑞貝卡能否作為他在美國的耳目，幫他打探聖殿騎士的動向。肖恩與瑞貝卡同意了蓋文的請求。接下來幾個月裡，瑞貝卡數次向蓋文發送了聖殿騎士行動的情報。8月27日，瑞貝卡向蓋文發了一份電子郵件，郵件中稱，她和肖恩決定追查戴斯蒙德的屍體在死後到底經歷了什麼事情，以此對威廉表達敬意。

肖恩與瑞貝卡在「農場」

9月3日，瑞貝卡在內布拉斯加州的阿萊恩斯發現了一份阿布斯泰戈娛樂發出的電子郵件，這封郵件是一份招聘新員工的郵件。她隨後給蓋文發了電子郵件，在郵件中表示聖殿騎士近來將相當一部分資源投入到阿布斯泰戈娛樂，這件事背後一定有什麼事正在發生。她告訴蓋文，她與肖恩正準備前去調查。

路上，他們經過了南達科他州，造訪了戴斯蒙德出生長大的「農場」。「農場」已經化作滿地廢墟。瑞貝卡說，他們對戴斯蒙德的了解並不多。肖恩則回應道，雖然如此，但他們與戴斯蒙德也一同經歷了許多事情，改變了世界。肖恩的回答安慰了瑞貝卡。

埃裡克、蓋文和蘇珊

9月11日，蓋文小隊在火奴魯魯港暫作停頓。蘇珊想知道他們為何至今沒有抵達大阪，蓋文回答稱曾經作為他導師的大阪兄弟會領袖望月見一遲遲沒有聯繫他，他對此深感擔憂。埃裡克表示，來自大阪兄弟會的一切聯絡在12月都處於靜默狀態，但蓋文告訴其他人，他和望月見一之間有著特殊的聯絡方式。

蘇珊開始擔心，大阪兄弟會已經成為了引誘他們前去大阪的陷阱。但蓋文向她保證說，即便是陷阱，他們也不會中招。隨後，他指令埃裡克啟航前往菲律賓，表示他們要先去那裡「購物」。到10月1日，他們從菲律賓當地的軍火商那裡買到了需要的武器，全程由埃曼努埃爾監督。

10月11日，蓋文讀了一篇文章。文章來自阿布斯泰戈娛樂蒙特利爾工作室，介紹了公司的創意總監奧利佛·加奈爾。蓋文隨後給瑞貝卡發了電子郵件，向她詢問奧利佛的身份與他可能知道的事情。

在阿布斯泰戈的秘密工作

阿布斯泰戈娛樂內的肖恩和瑞貝卡

10月24日，肖恩和瑞貝卡來到蒙特利爾，並成功地混入了阿布斯泰戈娛樂。肖恩在一樓大廳的咖啡吧檯做服務員，方便與假裝成快遞員的瑞貝卡進行聯繫。在某個時候，肖恩與瑞貝卡接觸了IT部門主管約翰·斯坦迪什，讓他作為他們在阿布斯泰戈娛樂公司內部的臥底，幫助他們進入阿布斯泰戈娛樂的伺服器。

但是，肖恩和瑞貝卡並不知道約翰其實是伊述成員艾塔在人類中的轉世——聖者，同時也是第一文明的僕從中的一員。約翰利用這次機會，積極地利用刺客們混進了阿布斯泰戈娛樂大樓，以此執行他自己復活艾塔生前妻子——朱諾的計劃。

在就職後的最初幾週裡，約翰詢問了好幾個研究員是否願意幫助他，但卻被他們一一拒絕。最後，10月29日，有一個新的研究分析員進入了公司，成為了第一個（也是最後一個）願意幫助約翰的人。在約翰的指示下，研究分析員入侵了電腦、Animi機器、安保攝像頭以及大樓裡的幾台伺服器，為刺客們竊取有關阿布斯泰戈行動的情報，但研究分析員起初並未察覺。

獲得一些資料檔案後，研究分析員會被叫去把這些情報交給瑞貝卡和肖恩。瑞貝卡會定期到肖恩的咖啡吧檯去取走這些情報。在約翰真正的意圖暴露並被阿布斯泰戈安保人員擊斃之後，瑞貝卡和肖恩直接聯繫了研究分析員，表示如果研究分析員願意繼續幫助他們，他們很願意將入侵計劃繼續下去。

等研究分析員將阿布斯泰戈從戴斯蒙德屍體上了解的一切，包括戴斯蒙德給父親錄下的備忘錄音都交給刺客之後，威廉終於決定結束隱居，繼續行動，並給研究分析員發了一條感謝資訊。

12月2日，瑞貝卡給蓋文發了郵件，將約翰的死訊與他們準備離開蒙特利爾的想法告訴了蓋文。離開蒙特利爾後，他們打算分析他們收集到的情報，為下一步行動做好計劃。

招募夏洛特

2015年9月之前，澤維爾·陳監督一支刺客小組執行任務，但任務不幸慘敗，只有澤維爾和其中的約瑟夫·勞裡爾活了下來，而約瑟夫的愛人克裡斯蒂安也死在了任務當中。

夏洛特和加林娜對峙約瑟夫

2015年9月15日，一支由澤維爾·陳、加林娜·沃羅寧娜和科迪·亞當斯組成的新刺客小組在聖地亞哥從聖殿騎士的伏擊隊救出了他們曾經考慮招募的鷹眼視覺擁有者夏洛特·德·拉·克魯茲。刺客收到的情報顯示，已經失去聯繫的前刺客約瑟夫·勞裡爾已與聖殿騎士取得聯繫，以告知他們塞勒姆審巫案期間被其祖先隱藏起來的神器。為了確定他是在說真話還是在誘捕聖殿騎士，夏洛特被迫在Animus中重溫她17世紀的祖先托馬斯·斯托達德的記憶。

隨著時間的流逝，加林娜向團隊施壓，迫使他們在當地的聖殿騎士總部與聖殿騎士們對峙。夏洛特起初相信約瑟夫說的是實話，但後來透過她祖先的記憶發現了他的背叛。然而，約瑟夫趁機殺死了澤維爾，並重傷了加林娜。但約瑟夫並不真是與聖殿一條心，他用炸藥炸死了迪迪爾在內的許多聖殿，完成了曾經身為刺客時的任務之後逃走了。

伊甸三叉戟

2016年，刺客兄弟會發現出逃在外的前阿布斯泰戈職員門羅終於現身。於是，他們派格裡芬前去調查情況。發現門羅招募了一群青少年，這群青少年在使用Animus的時候發現了新的伊甸碎片的下落。他們想要得知這些青少年所知道的事情，還要阻止聖殿騎士搶先找到它們。之後，在阿布斯泰戈特工當街攔住歐文的時候，格裡芬出手幫了歐文一把，不過歐文卻趁機在門羅的幫助下逃走了。

格裡芬的介入也沒能阻止聖殿騎士最後前先一步找到門羅藏身的倉庫。在青少年們重歷祖先記憶的時候，聖殿騎士派出的突擊小隊闖進了倉庫，抓住了娜塔莉亞、格蕾絲、大衛與肖恩四人。但是，歐文和哈維爾因為出血效應而順利逃脫，格裡芬依靠他們偷走的阿布斯泰戈摩托上的追蹤裝置找到了他們。格裡芬最後說服了他們與刺客合作。於是，他們兩人把他們在Animus裡的經歷告訴了格裡芬，表示他們發現伊甸匕首被轉交給了尤利西斯·S·格蘭特將軍，他把匕首儲存在他的住處，直到去世。

格裡芬回到安全屋後，接到了蓋文·班克斯的電話，得知伊甸匕首實際上是伊甸三叉戟的三把戟尖之一。隨後，他們搭乘私人飛機前往紐約，然後駕駛汽車來到了格蘭特故居。但是門羅已經搶先抵達了格蘭特故居，他們所要尋找的戟尖已經消失的無影無蹤，存放處空無一物。就在他們要離開的時候，三架滿載著聖殿騎士特工的直升機飛到格蘭特故居上空。歐文在逃離故居時，用電磁脈衝手雷擊落了兩架直升機，隨後因為違反了格裡芬之前下達的不要與聖殿騎士交戰的指令而遭到批評。格裡芬還威脅稱，要是歐文再次違背他的指令，他就收回之前同意幫歐文證明父親清白的承諾。他隨後提醒歐文與哈維爾兩人，阿布斯泰戈想要得到的三件伊甸碎片全部下落不明——在聖殿騎士看來，歐文他們還有那些被阿布斯泰戈抓走的少年少女就是找到這些碎片的關鍵。格裡芬給了歐文和哈維爾一個做出選擇的機會，問他們是否要繼續下去。哈維爾打算拒絕，但歐文卻願意接受格裡芬的請求。

格裡芬花了幾週時間訓練了歐文與哈維爾，把格鬥基礎和自由奔跑教給了他們。之後，格裡芬收到來自蓋文的警告，得知他們在阿布斯泰戈裡的線人羅滕堡發現格裡芬位於倉庫裡的安全屋已經暴露，受命立刻前去與瑞貝卡·克瑞恩會合。格裡芬在帶著歐文、哈維爾撤離的時候炸毀了安全屋，又因為聖殿騎士突擊小隊來的早於預期而放棄了自己的車。在放倒追上來的聖殿騎士特工後，格裡芬教了他們兩人如何在現代大隱於市——搭乘出租車前往他們新的安全屋。來到新的安全屋後，他們遇到了瑞貝卡。瑞貝卡已經為歐文安裝好了Animus。她向歐文解釋說，他一位來自中國的祖先曾在1259年見到過第二把戟尖。不久之後，她就因為需要執行另一項任務而離開了。

在監督歐文Animus重歷的時候，格裡芬十分不情願地同意了哈維爾離開安全屋的請求。但哈維爾對格裡芬撒了個小謊，偷了格裡芬的車去警察的倉庫裡偷走了歐文父親的案件卷宗資料。哈維爾回到安全屋之後，格裡芬為他這種可能給安全屋帶來危險的冒險行為批評了他，並向哈維爾介紹了教條的三項原則，告訴哈維爾他應該為自己沒有出賣刺客兄弟會而慶幸。但哈維爾抗議稱自己還不是刺客，格裡芬表示他早晚得選擇到底站到哪一邊。

歐文離開Animus時對於第二把戟尖的下落一無所知。但格裡芬把哈維爾的莽撞行為告訴了歐文。歐文瀏覽了那些證據，找到了一份包含了父親在搶劫案後DNA的唾液樣本。格裡芬表示，他們要先找到Helix機器，連接上阿布斯泰戈雲才能查看他父親的基因記憶。

格裡芬隨後聯繫了蓋文，詢問是否有更多來自羅滕堡的情報，卻得知這個線人處於靜默狀態。格裡芬要繼續尋找戟尖，只能依靠聖殿騎士那裡的其他青少年。歐文和哈維爾堅持與格裡芬同行，提出了其他人不會信任格裡芬的理由。得到同意之後，三人裝備上致痛手雷與激光輻射器，開車來到鷹巢附近。歐文與哈維爾的朋友們就被軟禁在鷹巢裡。格裡芬將避開安保系統的方法告訴了歐文和哈維爾。不幸的是，在潛入過程中格裡芬與歐文、哈維爾分開了。為了給他們兩人開路，格裡芬決定暴露自己，吸引聖殿騎士。不久後，他甩掉聖殿騎士，與救出娜塔莉亞與大衛的哈維爾會合。娜塔莉亞和大衛決定逃離聖殿騎士的掌控，但肖恩和格蕾絲選擇留下。之後，格裡芬開著青少年們偷來的高科技汽車，利用車子的隱形功能，帶著他們逃出了鷹巢。他得知，門羅也進行了營救青少年的活動，只是與歐文一同被困在了鷹巢裡。

回到安全屋後，格裡芬想要立即轉移，認為歐文很可能遭到藥物審訊，或是被用Helix分析了DNA。他聯繫了蓋文，得知羅滕堡對此次突襲很不滿，差點因此失去與刺客兄弟會之間的聯繫。羅滕堡還透露道，聖殿騎士以賽亞正計劃遠征蒙古。確認安全屋暫時安全以及以賽亞幾天之內不會啟程之後，格裡芬請求娜塔莉亞是否可以回到Animus裡找到第二把戟尖。娜塔莉亞提出要格裡芬帶他們所有人一起去蒙古，與蓋文協商後才同意格裡芬的請求。

之後，格裡芬、娜塔莉亞、大衛與哈維爾四人搭乘貨運飛機來到了中國北京。在飛機上的時候，格裡芬邀請哈維爾加入刺客兄弟會，哈維爾對于格裡芬告訴他的在找到三叉戟所有戟尖後就給他安排入會儀式的事情很感興趣，不過格裡芬告訴哈維爾，這件事情可能要之後再談了。等他們抵達中國後，他們得到了來自中國刺客燕玫的歡迎。然後，他們搭乘燕玫提供的私人飛機，飛往蒙古。

技巧

美國刺客兄弟會（包括原來的殖民地刺客兄弟會）的成員都要接受潛行、竊聽、劍術、射擊術、自由奔跑、扒竊、開鎖等諸多本領的訓練。在裝備上，絕大多數殖民地刺客都會裝備袖劍、劍與手槍，其中一部分刺客還會使用繩鏢。

殖民地刺客兄弟會時期的刺客海軍艦隊規模龐大，許多屬於刺客的戰艦游弋在各地的海面上。

他們絕大部分的刺殺技巧與土耳其刺客兄弟會或意大利刺客兄弟會基本一致，但他們還在訓練中學會了利用灌木叢、懸崖與樹木的掩護與高度取得針對高大建築的優勢。

在拉通哈給頓重建兄弟會後，美國刺客兄弟會變得更加多元化、專門化。拉通哈給頓招募的刺客學徒各有各擅長的近戰或遠程武器。北美原住民的武器也得到了使用，非原住民也會使用這些武器，雅各·曾格使用的就是原住民的戰棍。與其他時代不同，這些刺客會攜帶兩把燧發槍以供使用。每個刺客都會從其他人那裡學到諸如設下埋伏或是偽裝成士兵與巡邏隊一同護送拉通哈給頓這樣的新本領。他們還接受了有關航海的訓練，可以藉助刺客旗艦天鷹號執行契約任務。

外觀

從殖民地時期開始，美國刺客就沒有統一的刺客長袍或是制服，也沒有其他兄弟會那樣統一的服裝配色。大多數刺客的穿著與平民無異，不過霍普、肯瑟苟沃斯、維倫德裡騎士和利亞姆這樣的高階刺客並非如此，他們擁有帶有兜帽的精緻長袍。儘管如此，殖民地刺客兄弟會在七年戰爭時期可能存在過制服，可能是「黑幫頭目」所穿的那種衣服，他們在表現上就像是接受過高度技能訓練的刺客兄弟會正式成員。在拉通哈給頓重建美國刺客兄弟會之後，新招募的成員並不穿刺客長袍，也不戴兜帽，只有拉通哈給頓仍舊穿著傳統風格的帶兜帽的刺客長袍。

所有的殖民地刺客以及美國刺客身上攜帶的手槍與近戰武器都直接暴露在外。殖民地時期，刺客們不會穿金屬盔甲，但有些刺客還是會穿用狩獵到的動物製作出來的皮甲。美國刺客兄弟還採取了將整把袖劍及機關都藏在袖子底下的做法，而不是把袖劍戴在袖子外面。這樣一來，刺客們能更好地混跡於人群之中。

成員

殖民地刺客兄弟會時期

成立前

• 約翰·德·拉圖爾
• 瑪爾戈

七年戰爭

• 阿塔夏塔的父親
• 皮耶爾·貝萊克（巴黎兄弟會）
• 謝伊·科馬克 （已背叛）
• 邁克爾·克勞利（已退出）
• 霍普·詹森
• 肯瑟苟沃斯
• 利亞姆·奧布萊恩
• 老本傑明·塔爾梅齊
• 維綸德裡騎士，路易-約瑟夫·高緹耶

美國獨立戰爭

• 阿塔夏塔
• 多比·卡特
• 史蒂芬·夏菲爾
• 傑米·科利
• 阿基裡斯·達文波特（導師; 1746 – 1763/1769 – 1781）
• 羅伯特·福克納
• 凱萊布·加勒特
• 喬克·麥克雷
• 喬
• 鄧肯·利托
• 拉通哈給頓
• 威廉·德·聖-普裡（巴黎兄弟會）
• 克裡普·威爾金森
• 雅克·曾格

美國刺客兄弟會時期

獨立戰爭之後

• 佩瑟絲·吉伯斯
• 拉通哈給頓

南北戰爭

• 美國刺客（1852）
• 美國導師（導師; 約1863年）
• 伊莉莎
• 維琉斯
• 維琉斯的父親

20世紀

• 爵士時代刺客
• 德懷特·亞當斯（西班牙兄弟會）
• Dhogura
• Doni
• 茱莉亞·達斯克
• Alekseï Gavrani
• Julia Gorm
• William Greer
• William King Harvey （betrayed）
• 鮑裡斯·帕什
• Zenia

現代

• 科迪·亞當斯
• 蓋文·班克斯
• 埃曼努埃爾·巴拉薩
• 保羅·貝拉米
• 澤維爾·陳
• 史蒂芬妮·趙
• 克裡斯蒂安
• 埃裡克·庫珀
• 瑞貝卡·克瑞恩
• 丹尼爾·克洛斯（已背叛）
• 夏洛特·德·拉·克魯茲
• 哈蘭·T·康寧漢姆
• 蘇珊·德雷頓（加拿大兄弟會）
• 格裡芬
• 肖恩·黑斯廷斯（不列顛兄弟會）
• 克萊·卡茨馬雷克

• 約瑟夫·勞裡爾（已背叛）
• 埃米特·利裡
• 邁歇爾·勒邁爾
• 戴斯蒙德·邁爾斯
• 戴斯蒙德·邁爾斯的母親
• 威廉·邁爾斯（導師；約2000 – 2013；2015 – 現在）
• 巴因德拉·米特拉 （未知亞洲兄弟會）
• 漢娜·米勒
• 阿卡基·尼尼茲（格魯吉亞兄弟會）
• 諾達爾·尼尼茲（格魯吉亞兄弟會）
• 阿倫德·舒特·康寧漢姆
• 露西·斯蒂爾曼（已背叛）
• 高倉清志（日本兄弟會）
• 加林娜·沃羅寧娜（俄羅斯兄弟會）
• 燕玫（中國兄弟會）

盟友與支持者

殖民地刺客兄弟會時期

七年戰爭

• 阿德瓦萊（西印度群島兄弟會）
• 獵人
• 卡涅齊歐
• 加斯帕爾·貝拉斯克斯

美國獨立戰爭

• 阿爾蘇姆斯
• 塞繆爾·亞當斯
• 熱拉爾德·布朗（路易斯安那兄弟會）
• 埃米莉·伯克
• 本傑明·富蘭克林
• 艾弗琳·德·格朗普雷（路易斯安那兄弟會）
• 亨利·諾克斯
• 吉爾貝爾·杜·莫提耶，拉法耶特侯爵
• 斐利安·麥卡錫

• 鄧肯·麥吉爾
• 約翰·奧布萊恩
• 以色列·帕特南
• 保羅·裡維爾
• 小本傑明·塔爾梅齊
• 詹姆斯·米切爾·瓦納姆
• 喬治·華盛頓
• 奧索·威廉姆斯
• 海瑟姆·肯維（聖殿騎士組織美國分冊; 1777 - 1778）

美國刺客兄弟會時期

南北戰爭

• 尤利西斯·S·格蘭特
• 亞伯拉罕·林肯

20世紀早期

• 約翰·埃德加·胡佛
• 羅伯特·伯頓（英國兄弟會）
• 艾迪·高姆（英國兄弟會）

20世紀晚期

• 約翰·肯尼迪
• 阿爾·戈爾

21世紀

• 菜鳥
• 弗洛倫西亞（博學者）
• 海因裡希·哈特（已背叛）
• 珍妮絲（加拿大兄弟會）
• 阿德裡亞諾·馬埃斯特蘭齊（意大利兄弟會）
• 望月見一（日本兄弟會）
• 望月紗子（日本兄弟會）
• 格爾尼卡·莫尼奧（博學者）
• 約翰·斯坦迪什（已背叛）